Prof. Dr. Kemal Sami Korkmaz - XXVII. Ulusal Biyokimya Kongresi / 3
Transkript
Prof. Dr. Kemal Sami Korkmaz - XXVII. Ulusal Biyokimya Kongresi / 3
ÖZGEÇMİŞ 1. Adı Soyadı: Kemal Sami Korkmaz 2. Doğum Tarihi: 27.04.1964 3. Unvanı: Profesör 4. Öğrenim Durumu: Derece 5. Üniversite Alan Yıl Lisans Biyolojik Bilimler Orta Doğu Teknik Üniversitesi 1988 Y. Lisans Tıbbi Bioloji Dokuz Eylül Üniv. Sağlık Bilimleri Enst. 1992 Doktora Tıbbi Bioloji Dokuz Eylül Üniv. Sağlık Bilimleri Enst. 1997 Akademik Unvanlar: Görev Dönemi Üniversite Unvan Bölüm Profesör Profesör Ege Üniv. Biyomüh. Bl. Doçent Doçent Ege Üniv. Biyomüh. Bl. Yardımcı Doçentlik Tarihi : - Researcher Researcher Doktora Sonrası Sidney Kimmel Cancer Center, Dan Mercola laboratuvarı araştırmacı Amerika Doktora Sonrası Oslo Biyoteknoloji Merkezi Fahri Saatçioğlu Laboratuvarı Dokuz Eylül Üniv. Tıbbi Biyol. araştırmacı Ar. Gör. 6. Ar. Gör. Doçentlik Tarihi : 15 Aralık 2004 Profesörlük Tarihi : 17 Ocak 2012 Yönetilen Yüksek Lisans ve Doktora Tezleri 6.1. Yüksek Lisans Tezleri A. Kıvanç Sezer ; Prostat kanseri hücre hatlarında apoptoz oluşturulması ve mekanizmasının araştırılması B. Burcu Erbaykent ; Prostat kanserinde NKX3.1 transkripsiyon faktörünün DNA hasarı üzerine etki mekanizmasının araştırılması C. Nuray Böğürcü ; İzole Edilen ALCAP Moleküllerinin Kanser Hücrelerinde DNA Hasarı ve Onarımına Olan Etkilerinin İncelenmesi D. Cansu Alapınar Enflamatuvar mikroçevre ve Androjen ilişkisi E. Besra Özmen Prostat Kanser hücrelerinde çift sarmal kırık onarımının androjen ile değişiminin çalışılması F. Mert Burak Öztürk Doğal Ve Yarı Sentetı̇ k Saponı̇ n Grubu Moleküllerı̇ n Antı̇ -İnflamatuvar ve Antı̇ -Kanser Etkı̇ lerı̇ nin Araştırılması G. Nurşah Ertunç Prostat Kanseri Gelişiminde Androjenlerin Oksidatif Stres Kontrolündeki Rolünün Araştırılması 6.2. Doktora Tezleri A. Canan Sevimli ; Bazı Alkanna Türlerinin Biyoaktivite Rehberli İzolasyon Yöntemi Kullanılarak Çeşitli Kanser Hücreleri Üzerindeki Sitotoksik Etkilerinin in vitro Ortamlarda Taranarak, Hücresel Mekanizmalara ve Apoptoz Yolaklarına Olan Etkilerinin Araştırılması B. Hamid Syed Muhammad ; Role of a Homebox Protein HOXB13 in DNA Damage and Repair Mechanisms and as Transcription Factor C. Bilge Debeleç- Bütüner ; NKX3.1 Transkripsiyon Faktörünün Hedef Genlerinin ve Prostat Kanseri Gelişimindeki Etkisinin Araştırılması D. Lokman Varışlı ; Hücre Döngüsü kontrolünde HN1’in Rolü E. Burcu Erbaykent Tepedelen NKX3.1’in DNA hasarı onarımındaki rolü Yayınlar 7. 7.1. Uluslararası hakemli dergilerde yayınlanan makaleler (SCI & SSCI & Arts and Humanities) 1. Varisli L., Beyoglu G., Roumelioti F.M., Gonen-Korkmaz C., Gagos S., Korkmaz K.S. HN1 knockdown contributes to loss of centrosome assembly and function via regulating APC/C(Cdh1) during cell cycle progression and division. EMBO Reports, submitted) 2. The redox biology network in cancer pathophysiology and therapeutics. Manda G, Isvoranu G, Comanescu MV, Manea A, Debelec Butuner B, Korkmaz KS. Redox Biol. 2015 Jun 25;5:347-357. doi: 10.1016/j.redox.2015.06.014. Review. 3. Inflammation contributes to NKX3.1 loss and augments DNA damage but does not alter the DNA damage response via increased SIRT1 expression. Debelec-Butuner B, Ertunc N, Korkmaz KS. J Inflamm (Lond). 2015 Feb 15;12:12. doi: 10.1186/s12950-015-0057-4. eCollection 2015. 4. Organochlorine pesticides and antioxidant enzymes are inversely correlated with liver enzyme gene expression in Cyprinus carpio. Karaca M., Varis L., Korkmaz K.S., Ozaydın O, Percin F., Orhan H., Toxicology Letters 230 (2014) 198–207 5. Debelec-Butuner B., Alapinar C., Gonen-Korkmaz C., Yorukoglu K., Korkmaz KS. Enhanced Akt activity stabilizes -catenin and facilitates migration of prostate cells via disruption of E-cadherin association upon inflammation. PLoS ONE 9(10): e109868. doi:10.1371/journal.pone.0109868 6. Varisli, L., Ozturk B.E., Akyuz G.K., Korkmaz, K. S. HN1 associates with the GSK3β/β-catenin/APC complex, abrogates the E- cadherin/β-catenin interaction and facilitates the progression of prostate cancer cells. J of Cellular Biochemistry. 7. Debelec-Butuner, B., Korkmaz, K. S. NKX3.1 contributes to antioxidant response regulation via transactivating GPX2, QSCN6, SOD1 and SOD2. Turkish J. of Biology. Accepted. 2014 8. Erbaykent-Tepedelen B, Karamil S, Gonen-Korkmaz C, Korkmaz KS. DNA damage response (DDR) via NKX3.1 expression in prostate cells. J Steroid Biochem Mol Biol. 2014 May;141:26-36. 9. Mohammed, S., H., Çiçek, S., Karamil, S., Ozturk, M., B., Debelec-Butuner, B., Erbaykent-Tepedelen, B., Varisli, L., Yorukoglu, K., Gonen-Korkmaz, C., Korkmaz, K. S., (2013). HOXB13 contributes to G1/S and G2/M checkpoint control by regulating cyclin levels in prostate. Molecular and Cellular Endocrinology 2014. Mar 5;383(1-2):38-47. 10. Akay S., Ekiz G., Kocabas F., Hames-Kocabas E. E., Korkmaz K. S., Bedir E. A new 5,6-dihydro-2-pyrone derivative from Phomopsis amygdali, an endophytic fungus isolated from hazelnut (Corylus avellana). Phytochemistry Letters 7 (2014) 93–96 11. Debelec-Butuner B, Alapinar C, Varisli L, Erbaykent-Tepedelen B, Hamid SM, Gonen-Korkmaz C, Korkmaz KS. Inflammation-mediated abrogation of androgen signaling: An in vitro model of prostate cell inflammation. Molecular Carcinog. 2014 Feb;53(2):85-97 12. Xie L, Korkmaz K, Braun K, Bock J. Early Life Stress-induced Histone Acetylations Correlate with Activation of the Synaptic Plasticity Genes Arc and Egr1 in the Mouse Hippocampus. J Neurochem. 2013 Feb 16. doi: 10.1111/jnc.12210. 13. Varisli L., Korkmaz C., Mohammed S. H., Bogurcu N., Debelec-Butuner B., Erbaykent-Tepedelen B., Korkmaz K.S., Androgen regulated HN1 leads proteosomal degradation of androgen receptor (AR) and negatively influences AR mediated transactivation in prostate cells. Molecular and Cellular Endocrinology 350 (2012) 107 - 117 14. Erbaykent-Tepedelen B., Özmen B., Varisli L., Gonen-Korkmaz C., Debelec-Butuner B., Syed M.H., Yilmazer-Cakmak O., Korkmaz K.S., NKX3.1 contributes to S phase entry and regulates DNA damage response (DDR) in prostate cancer cell lines. Biochem Biophys Res Commun. 2011 Sep 12; 414 (1): 123-128 15. Bogurcu N., Sevimli-Gur C., Ozmen B., Bedir E., Korkmaz K.S., ALCAPs induce mitochondrial apoptosis and activate DNA damage response by generating ROS and inhibiting topoisomerase I enzyme activity in K562 leukemia cell line. Biochem Biophys Res Commun. 2011 Jun 17; 409(4): 738-44. 16. Varisli L., Korkmaz-Gonen C., Tepedelen-Erbaykent B., Debelec-Butuner, Syed Muhammed H., Bogurcu N., Saatcioglu F., Korkmaz K.S., Ubiqutiously expressed HN1 down-regulates Akt mediated GSK3beta signaling, and its knockdown results with deregulated G2/M transition in prostate cells. DNA and Cell Biol. 2011 Jun; 30(6):419-29 17. Gur, C., Akgun, I.H., Bedir, E., Korkmaz, K. S., Structure and activity relation in Alkanna. J. Nat. Prod. 2010 18. Azbar, N; Dokgoz, FT; Keskin, T; Eltem R., Korkmaz KS., Gezgin Y., Akbal Z., Oncel S., Dalay MC., Gonen C., Tutuk F., Compara tive Evaluation of Bio-Hydrogen Production From Cheese Whey Wastewater Under Thermophilic and Mesophilic Anaerobic Conditions. International Journal of Green Energy, 6 (2): 192-200, 2009 19. Akgun I., Ganzera M., Gur C., Senol S. Korkmaz K.S., Bedir E., Determination of Naphthazarin Derivatives in 16 Alkanna Species by RP-LC Using UV and MS for Detection. Chromatographia, 70 (5-6): 963-967, 2009 20. Sevimli-Gur C., Korkmaz K.S., Akgun I.H., Bedir E., Chemistry and Biological Activities of Naphthoquinones from Alkanna cappadocica Boiss. & Bal. Planta Med, 75 (9): 980-980, 2009 21. Sevimli-Gur C., Bedir E., Bickici S., Korkmaz K.S., Biological activities of Turkish Alkanna species. Planta Med., 75 (9): 978-979, 2009 22. Habold C., Gali-Muhtasib H., Korkmaz K.S., Hartig R., Roessner A., Schneider-Stock R. Acetylation-dependent upregulation of p21WAF1 expression after H2O2-associated DNA-damage in colorectal cancer cells. J Cell Mol Med. 2008 Mar-Apr; 12(2): 607-21. 23. Pekin, G., Ganzera, M., Senol, S., Bedir, E., Korkmaz, K. S., Stuppner, H. Determination of naphthazarin derivatives in endemic Turkish Alkanna species by reversed phase high performance liquid chromatography. Planta Med. 73(3): 267-72, 2007 24. Korkmaz C.G., Korkmaz K.S., Kurys P., Elbi C., Klokk T.I., Hammarstrom C., Svindland A., Hager G.L., and Saatcioglu F. Molecular cloning and characterization of STAMP2, an androgen regulated six-trans-membrane protein that is overexpressed in a subset of prostate cancers. Oncogene. Jul 21;24(31):4934-45, 2005 25. Hayakawa J., Mittal S., Wang Y., Korkmaz K.S., Adamson E., English C., Omichi M., McClelland M., Mercola D. Identification of promoters bound by c-Jun/ATF2 during rapid large-scale gene activation by genotoxic stress. Molecular Cell., 16 (Nov 19): 1-20, 2004 26. Korkmaz C.G., Korkmaz K.S., Manola J., Xi Z., Risberg B., Danielsen H., Kung J., Sellers W.R., Loda M., Saatcioglu F. Analysis of androgen regulated homeobox gene NKX3.1 during prostate carcinogenesis. J Urology, 172(3):1134-9, 2004 27. Xi Z., Klokk T. I., Korkmaz K.S., Kurys P., Elbi C., Risberg B., Danielsen H., Loda M., Saatcioglu F. Kallikrein 4 Is A Nuclear Protein That Is Over-Expressed In Prostate Cancer. Cancer Research, 64(7):2365-70, 2004 28. Adamson E., de Bell I., Mittal S., Wang Y., Hayakawa J., Korkmaz K., OHagan D., McClelland M., Mercola D. Egr1 signaling in p rostate cancer. Cancer Biology & Therapy, 2(6):617-622, 2004 29. Skotheim, R.I., Korkmaz, K.S. Klokk, T. I., Abeler, V. M., Korkmaz, C. G., Nesland, J. M., Fossa, S. D., Lothe, R. A., Saatcioglu, F. NKX3.1 Expression Is Lost in Testicular Germ Cell Tumors. American J Pathology, 163: 2149-2154, 2003 30. Korkmaz K.S., Elbi C. C., Korkmaz C. G., Loda M., Hager G.L., Saatcioglu F. Molecular cloning and characterization of STAMP1, a highly prostate specific six-trans-membrane protein that is overexpressed in prostate cancer. J. Biological Chemisty 277(39): 3668936696, 2002 31. Korkmaz K.S., Korkmaz C.G., Pretlow T.G., Saatcioglu F., "Distinctly different gene structure of KLK4/KLK-L1/Prostase/ARM1 compared with other members of the kallikrein family - Perinuclear localization, alternative cDNA forms and regulation by multiple hormones." DNA and Cell Biol., 20(7):435-445, 2001 32. Matsuda T., Junicho A., Yamamoto T., Kishi H., Korkmaz K., Saatcioglu F., Fuse H., and Muraguchi A. Cross-talk between Signal Transducer and Activator of Transcription 3 and Androgen Receptor signaling in Prostate Carcinoma Cells. Biochem. Biophys. Res. Com., 283:179-187, 2001 33. Junicho A., Matsuda T., Yamamoto T., Kishi H., Korkmaz K., Saatcioglu F., Fuse H., and Muraguchi A. Protein inhibitor of activated STAT3 regulates androgen receptor signaling in prostate carcinoma cells. Biochem. Biophys. Res. Com., 278(1):9-13, 2000 34. Korkmaz K.S., Korkmaz C.G., Ragnhildstveit E., Kizildag S., Pretlow T.G., Saatcioglu F., "Full-length cDNA sequence and genomic organization of human NKX3A - Alternative forms and regulation by both androgens and estrogens." Gene 260(1): 25-36, 2000 35. Korkmaz K.S., Korkmaz C.G., Ragnhildstveit E., Saatcioglu F., "An efficient Procedure for Cloning Hormone Responsive Genes from a Specific Tissue." DNA and Cell. Biol. 19(8): 499-506, 2000. 36. Guran S., Bahce M., Beyan C., Korkmaz K.S., Yalcin A. " p53, p15 INK4B, p16INK4A, and p57KIP2 mutations during the progression of chronic myeloid leukemia" Heamatologia, 29(3): 181-183, 1998 37. Sercan H.O., Korkmaz K.S., Yazıcioglu M.V., Sakizli M., Buyukgebiz A." Two Brothers with a 7.0 KB Gene Deletion Associated with Isolated Growth Hormone Deficiency type 1A" J Pediatr Endocrinol Metab., 9 (3): 423-7, 1996. 38. Cingöz S., Yörükoğlu K., Atabey N., Korkmaz K. S., Özen E., Sakızlı M., " DNA Isolation of DNA for Polymerase Chain Reaction From Formalin-fixed and Paraffin-embedded Tissues", Turkish Journal of Medical Sciences, 24 (4): 259-262, 1995. 39. Korkmaz K.S., Sercan H.O., Yazicioglu M.V., Sakizli M., Buyukgebiz A." A case with 6.7 KB Gene Deletion Associated with Isolated Growth Hormone Deficiency type 1A.", Turkish Journal of Paediatrics, Jan-March 39: 99-104, 1997. 40. Çelik Ş., Korkmaz K.S., Sarıoğlu S., Küpelioğlu A., Sakızlı M., " Detecting p53 exon 7 mutations of Colorectal carcinomas by Restriction Enzyme Analysis " Turkish Journal of Cancer, 28(4): 174-8, 1998 41. Sarıoğlu S., Pabuççuoğlu U., Korkmaz K.S., Bilkay İ., Akman F., Kuyucuoglu F., Baskın H., Güneri A.,“ Epstein-Barr virus infection and nasopharyngeal carcinoma” Turkish Journal of Cancer, 27(1):5-12, 1997 42. Tezel A., Korkmaz K.S., Çelik Ş., Sarıoğlu S., Özer E., Atabey A., Sakızlı M., “Microsatellite Instability in Malign Melanoma and Melanocytic Nevi.” Kanser Gündemi, 2/3 July 1997. 7.2. Uluslararası diğer hakemli dergilerde yayınlanan makaleler 7.3. Uluslararası bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitabında (Proceedings) basılan bildiriler 1. Lokman Varisli, Ceren Gonen-Korkmaz, Hamid Syed Muhammed, Bilge Debelec-Butuner, Burcu Erbaykent-Tepedelen, Kemal Sami Korkmaz. Androgen regulated HN1 leads proteosomal degradation of Androgen Receptor and negatively influences AR med iated transactivation in prostate cells. Growth and Proliferation: Molecular Regulators of Cancer. Sept 5-8, 2011, Oslo. Norway 2. Varisli L., and Korkmaz K.S. " HN1 is a novel EGF regulated gene that is involved in AKT mediated GSK3 consquently B -catenin signaling" 4th International Congress of Molecular Medicine, Yeditepe University, 2011, Istanbul-Turkey. 3. Varisli L., and Korkmaz K.S. " HN1 is an androgen regulated gene, negatively regulates androgen receptor signaling in prostate cancer cells" 4th International Congress of Molecular Medicine, Yeditepe University, 2011. Istanbul-Turkey. 4. Hamid, M. S., Varisli, L., Erbaykent, T. B., Debelec, B. B., and Korkmaz, K.S. ''Hoxb13 associates with cell cycle regulators, arrests cells at G1/S transition and its knockdown drives prostate cancer cells''. 4th. International Congress of Molecular Medicine, Yeditepe University, Istanbul, Turkey. 2011. 5. Debelec-Butuner B., Alapinar C., Erbaykent-Tepedelen B., Muhammed H.S., Varisli L., Korkmaz K.S., “Loss of NKX3.1induced by inflammatory cytokines in prostate cancer development”, The COST Action BM0703 – Cancer and Control of Genomic Integrity, 3rd Genomic Instability Workshop, Milano, Italy. 2010. 6. Debelec-Butuner B., Erbaykent-Tepedelen B., Muhammed H.S., Varisli L., Bogurcu N., Korkmaz K.S., “An Inflammation Model for Studying NKX3.1 Tumor Suppressor Function in LNCaP Cells”, International Postgraduate Student Meeting on Pharmaceutical Sciences, Cesme Turkey. June 24-27 2010, Oral Presentation. 7. Debelec-Butuner B., Varisli L., Korkmaz K.S., “Identification of transcriptional targets of NKX3.1”, 9th International Symposium on Pharmaceutical Sciences (ISOPS-9), Ankara, Turkey. 2009. 8. Debelec-Butuner B., Korkmaz K.S., “Recombinant protein production of prostate tissue spesific NKX3.1 and STAMP1 proteins” 9th International Symposium on Pharmaceutical Sciences (ISOPS-9) Ankara, Turkey. 2009 9. Hamid, M. S., Erbaykent, T. B., Debelec, B. B., Varisli, L., Bogurcu, N. and Korkmaz, K.S. ''Functional characterization of HOXB13 targets in prostate''. High-throughput screens in genome integrity and cancer. Gray Institute for Radiation Oncology and Biology, Oxford University, Oxford, UK. 2009. 10. Varisli L., Erbaykent-Tepedelen B., Bogurcu N., Muhammed H.S., Debelec-Butuner B., Sevimli-Gur C., Korkmaz K.S., “HN1: An EGF Responsive Gene Regulates Cell Cycle in Prostate Cancer” 2nd Annual Meeting on Cancer and Control of Genomic Integrity, Stockholm-Sweden. 2009. 11. Erbaykent-Tepedelen B., Debelec-Butuner B., Varisli L, Muhammed S.H., Bogurcu N., Gonen-Korkmaz C., Korkmaz K.S. “NKX3.1 abrogates DDR and promotes growth arrest in prostate cell lines” 2nd GENICA/CANGENIN Genomic Instability Workshop, Athens, Greece. 16-19 May 2009, poster presentation. 12. Erbaykent-Tepedelen B., Butuner B.D., Varisli L., Sevimli C., Muhammed H.S., Bogurcu N., Korkmaz, K.S. “Ectopic expression of NKX3.1 blocks DNA damage related H2AX phosphorylation and promotes growth arrest in prostate cancer cell lines” IV. International Bioengineering Congress, Izmir, Turkey. Oct 15-18 2008, poster presentation. 13. Erbaykent-Tepedelen B., Gonen-Korkmaz C., and Korkmaz K.S., “Ectopic expression of NKX3.1, restores DNA damage related H2AX phosphorylation and promote senescence in prostate cancer cell lines” EYSF (European Young Scientist Forum), 2008 14. Varisli L., and Korkmaz K.S. “HN1 is an EGF Responsive Gene and Involved in Cell Cycle Regulation” II. Multidisipliner Kanser Araştırma Sempozyumu, Uludağ, Bursa. 24-27 Şubat 2008. 15. Sevimli C., Şenol S., Akgun I., Caliskan O.A., Bedir E., Korkmaz K.S., Cytotoxic and DNA Damage Effect of Topoisomerase Inhibitors Isolated From Endemic Alkanna Species on Cancer Cells. Multidisiplinary Cancer Symposium 2008. Bursa-Uludag, TURKEY 16. Erbaykent-Tepedelen B., Butuner B.D., Korkmaz K.S. “Is NKX3.1 a balancing factor between cell survival and apoptosis?” Molecular Biomimetics & Bionanotechnology-II International Workshop, Istanbul Technical University (ITU-MOBGAM), Istanbul, Turkey, May 23-25, 2007, poster presentation. 17. Varisli L., and Korkmaz K.S. “In silico investigation of differentially expressed genes in androgen treated LNCaP cells” Mole cular Biomimetics&Bionano Technology II. Dr. Orhan Ocalgiray Molecular Biology-Biotechnology&Genetics Research Center MOBGAM ITU, İstanbul/Turkey. 23-25 may 2007 18. Sevimli C., Bıçkıcı S., Nalbantoglu S., Şenol S., Gürhan I.D., Korkmaz K.S., Bedir E., Topoisomerase Inhibitors, Cytotoxic Activity of the Roots and Aerial Parts of Alkanna in Various Human Cancer Cell Lines. FEBS Meeting, 2006 İstanbul 19. Korkmaz K.S., Korkmaz C.G., Hayakawa J., Mittal S., Wang Y., Adamson E., Mcclelland M., Mercola D. Profiling of androgen receptor regulatory transcriptional complexes in prostate cancer. 96 nd American Association for Cancer Research, Anaheim, USA, 2005 20. Korkmaz K.S., Korkmaz C.G., Pretlow T.G., Saatcioglu F., "Distinctly different gene structure of KLK4/KLK-L1/Prostase/ARM1 compared with other members of the kallikrein family - Perinuclear localization, alternative cDNA forms and regulation by multiple hormones." 3rd Nuclear Receptors Meeting, Oslo, NORWAY, 2001. 21. Korkmaz K.S., Sercan H.O., Yazicioglu M.V., Sakizli M., Buyukgebiz A."Isolated Growth Hormone Deficiency Type 1A Associated with 7.0 KB Gene Deletion" 16th International Symposium on Growth and Growth Disorders, Lisbon, PORTUGAL. 1993. 22. Sercan H.O., Korkmaz K.S., Yazicioglu M.V., Sakizli M., Buyukgebiz A."Isolated Growth Hormone Deficiency Type 1A Associated with 7.0 KB Gene Deletion" 21st Congress of Union of Middle Eastern and Mediterranean Paediatric Societies, Izmir, TURKEY. 1993. 7.4. Yazılan uluslararası kitaplar veya kitaplarda bölümler 1. Kemal KORKMAZ, Ceren Gönen KORKMAZ “Kanserde DNA Hasarı ve Onarım Mekanizmaları” MEME KANSERİNE MOLEKÜLER VE GENETİK YAKLAŞIM, Bölüm 1: Genel Kanser Biyolojisi, Ege Üniversitesi yayınları. ISBN: 978-975-483-928-9, 2011 2. Kemal KORKMAZ “DNA Hasarı ve Onarım Mekanizmaları” Dokuz Eylül Üniversitesi yayınları, Hücre Ölümü Araştırma derneği yayınları I., 2011 7.5. Ulusal hakemli dergilerde yayınlanan makaleler 1. Çelik Ş., Korkmaz K.S., Sarıoğlu S., Küpelioğlu A., Sakızlı M., " Detecting p53 exon 7 mutations of Colorectal carcinomas by Restriction Enzyme Analysis " Turkish Journal of Cancer, 28(4): 174-8, 1998 2. Tezel A., Korkmaz K.S., Çelik Ş., Sarıoğlu S., Özer E., Atabey A., Sakızlı M., “Microsatellite Instability in Malign Melanoma and Melanocytic Nevi.” Kanser Gündemi, 2/3 July 1997. 3. Sarıoğlu S., Pabuççuoğlu U., Korkmaz K.S., Bilkay İ., Akman F., Kuyucuoglu F., Baskın H., Güneri A.,“ Epstein-Barr virus infection and nasopharyngeal carcinoma” Turkish Journal of Cancer, 27(1):5-12, 1997 7.6. Ulusal bilimsel toplantılarda sunulan ve bildiri kitabında basılan bildiriler 7.7. Diğer yayınlar KORKMAZ K.S. “Gene Technologies And Its Applications” May 1-5, 2000, EBILTEM, IZMIR, TURKEY. 7.8. Uluslararası atıflar 26.04.2014 tarihinde >850 atıf (WEB of Science) 8. Ulusal & Uluslararası Projeler 105S101 TÜBİTAK- SBAG Genotoksik antikanser ekstrelerin elde edilmesi, hücresel mekanizmalara ve apoptoz yolaklarına olan etkilerinin araştırılması 106S200 TÜBİTAK- SBAG NKX3.1 Transkripsiyon Faktörünün Tümör Baskılayıcı Yeteneğinin Önemi Ve Prostat Kanserinde Hedef Genlerinin Araştırılması 108S288 TÜBİTAK- Prostat ve meme kanserinde DNA hasarına karşı gelişen dirençliliğin (fosforilasyon aracılıklı SBAG, COST 0708 mekanizmalarının) araştırılması 109T966 TÜBİTAK- TBAG NKX3.1 ve HOXB13 ‘ün rekombinant proteinlerinin üretilmesi 108Y474 TÜBİTAK- Büyük Menderes Sucul Ortamında Kalıcı Organik Kirletici ve Endokrin Bozucu Bileşiklerin Neden ÇAYDAG Olduğu Çevresel Kirlenmenin Analizi, Biyogöstergeler Aracılığıyla izlenmesi ve Toksik Etkilerinin Belirlenmesi 110S134 TÜBİTAK- SBAG Prostat ve meme kanserinde HN1’in hücre döngüsü kontrolündeki rolü 210T066 TÜBİTAK İKİLİ Hayvan depresyon modelinde Histonlardaki Epigenetik değişikliklerin rolü: erken stress deneyimi İŞBİRLİĞİ – BMBF sonrası oluşan kromatin yeniden yapılanması (Almanya) Ege Universitesi – BAP Genotoksik antikanser ekstrelerin elde edilmesi, hücresel mekanizmalara ve apoptoz yolaklarına olan etkilerinin araştırılması (CBBS) Center for Chromatin Remodelling related to stress- and learning-induced neuronal plasticity during early Behavioral and Brain development Sciences Dr. Joerg Bock, Otto von Guericke Magdeburg Univ. Doğa Bilimleri Fakültesi, Nörobiyoloji Bl. DFG/SBF 779 Influence of juvenile training on learning efficiency in adult animals Prof. Anna Katharina Braun, Otto von Guericke Magdeburg Univ. Doğa Bilimleri Fakültesi, Nörobiyoloji Bl. TÜBİTAK- 113S044 COST Oksidatif DNA hasarı aracılıklı prostat kanseri gelişimine androjenlerin etkisinin araştırılması 1203 TÜBİTAK- 113Z083 Siklin kompleksleri ve mitotik iğ ipliği oluşumları ile, HN1 aracılıklı hücre döngüsü kontrolünün çalışılması. 9. İdari Görevler Ege Üniversitesi, Mühendislik Fakültesi, BAP komisyonu üyeliği Tübitak – KBAG Yürütme Kurulu (Danışma) Üyeliği 10. Bilimsel ve Mesleki Kuruluşlara Üyelikler “Moleküler Kanser Araştırma Derneği”, MOKAD üyeliği “European Association for Cancer Research” derneği üyeliği “Hücre Ölümü Araştırma Derneği”, HÖAD yönetim kurulu üyesi, kurucu üyeliği ve başkan yardımcılığı. 11. Ödüller (Burslar) Tübitak NATO B2 Bursu (6 ay) Norveç Ulusal Kanser Enstitüsü Bursu ( 4 yıl) Amerikan Ulusal Kanser Enstitüsü, NCI (Amerika) post doc bursu (2 yıl) 12. Son iki yılda verdiğiniz lisans ve lisansüstü düzeydeki dersler için aşağıdaki tabloyu doldurunuz. Akademik Yıl Dönem Haftalık Saati Dersin Adı Teorik Güz Öğrenci Sayısı Uygulama Biyoinformatik I 7. yyıl 2 Uygulamalı Biyoinformatik YL 2 Moleküler Biyoloji 4. yyıl 3 30 Modern Biyoloji 4. yyıl 3 132 12 2 7 2010-2011 Bahar Güz Biyoinformatik I 7. yyıl 2 12 Genel Biyoloji I 5 (4 hafta) 50 Kanser Moleküler Biyolojisi 2 7 Moleküler Biyoloji 4. yyıl 3 Mol. Biolojide Özel Konular 2 Modern Biyoloji 4. yyıl 3 2011-2012 Bahar Biyoinformatik. (8. yarı yıl. Biyomühendislik Bölümü, Lisans programı, seçmeli ders) Uygulamalı Biyoinformatik (Fen Bilimleri Enstitüsü YL programı seçmeli ders) Moleküler Biyolojide Özel Konular (Fen Bilimleri Enstitüsü YL programı seçmeli ders) Biyoteknolojiye Giriş (8. yarı yıl. Kimya Bölümü, Lisans programı, seçmeli ders) Kanser Moleküler Biyolojisi (Fen Bilimleri Enstitüsü Doktora programı seçmeli ders) Kanser Biyolojisi (Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Temel Onkoloji YL ve Doktora programı Zorunlu ders) Modern Biyoloji (4. yarı yıl. Bilgisayar Bölümü, Lisans programı, Zorunlu ders) Moleküler Biyoloji (8. yarı yıl. Biyomühendislik Bölümü, Lisans programı, zorunlu ders) Bilimsel Toplantının Adı Yeri Tarihi UL UA K Y D B 4. Uluslararası Biyomühendislik Kongresi İzmir 2010 120 5. Uluslararası Biyomühendislik Kongresi İzmir 2012 140 1. Hücre ölümü araştırma Derneği Teorik İzmir Kasım 2011 190 Kursu Eskişehir Mart 2013 Çeşme- İzmir Kasım 2013 2237 Proje eğitimi kursu Gaziantep Ekim 2014 35 3. Hücre ölümü araştırma Derneği Kursu Gaziantep Ekim 2014 20 3. Hücre ölümü araştırma Derneği Pratik Celal Bayar Haz. 2015 16 Kursu Üniv. Manisa 2. Hücre ölümü araştırma Derneği Teorik 170 155 Kursu 1. Uluslararası Katılımlı Hücre ölümü araştırma Derneği Kongresi