Meme Kanseri Hastalarında JAM-A ve LFA
Transkript
Meme Kanseri Hastalarında JAM-A ve LFA
MEME KANSERİ HASTALARINDA JAM-A VE LFA-1 GEN VARYASYONLARININ ETKİSİNİN İNCELENMESİ Bengü TOKAT, 1,2 Deniz KANCA, Tülin ÖZTÜRK, M.Fatih SEYHAN, Zerrin CALAY, Şennur İLVAN, Özlem KURNAZ-GÖMLEKSİZ, Hülya YILMAZ-AYDOĞAN, Oğuz ÖZTÜRK 1 İstanbul Üniversitesi Deneysel Tıp Araştırma Enstitüsü, Moleküler Tıp AD, İstanbul Türkiye 2 Haliç Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü, İstanbul Türkiye 4 Kasım 2015 SUNUM AKIŞI GİRİŞ Meme kanseri JAM-A ve LFA-1 AMAÇ METOT BULGULAR TARTIŞMA XXVII. ULUSAL BİYOKİMYA KONGRESİ 4 KASIM 2015 MEME KANSERİ Poligenetik malign hastalıklardan biri ABD; Kadınlarda en yaygın 1. kanser türü Erkek: 2300 yeni vaka/yıl Kadın: 230000 yeni vaka/yıl Kadın Meme Anatomisi http://www.cancer.gov/types/breast http://seer.cancer.gov/statfacts/html/breast.html http://kanser.gov.tr/daire-faaliyetleri/kanser-kayitciligi/108t%C3%BCrkiyede-kanser-kayitcigi.html XXVII. ULUSAL BİYOKİMYA KONGRESİ 3-6 KASIM 2015 ANTALYA Neden JAM-A / LFA-1 ? Kanser hücrelerinde yuvarlanma, bağlanma ve transmigrasyon / diapedez adımlarıyla gerçekleşen ekstravazasyon, endotel hasarı / disfonksiyonuna bağlı lökosit ekstravazasyonuna benzemekte olup endotel kökenli JAM-A ve monosit kökenli LFA-1 molekülleri bu süreçte rol oynamaktadır. http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1471490612001329 http://jcs.biologists.org/content/117/1/19 XXVII. ULUSAL BİYOKİMYA KONGRESİ 3-6 KASIM 2015 ANTALYA Junctional Adhesion Molecule-A / Bağlantı Adezyon Molekülü-A (JAM-A) Hücreiçi bağlantı teşekkülü ve hücre polaritesi Hücre morfolojisi Anjiyogenez Platelet aktivasyonu Lökosit migrasyonu Monosit ve nötrofil ekstravazasyonu Normal meme dokusunda düşük düzeyde anlatımı yapılırken kanser hücrelerinde anlatımı artmaktadır. JAM-A geninin şematik diyagramı Ekspresyon ↑ tümör hücre migrasyonu ↑ invazyon ve metastaz Ekspresyon ↓ apoptoz ↑ kanser progresyonu ↓ Genin susturulması, JAM-A ‘nın epitel hücrelerin yayılma ve lökosit migrasyonunu artırmasıyla kanser hücrelerinin adhezyon ve migrasyonunu azaltarak kanser gelişimini azaltmaktadır. XXVII. ULUSAL BİYOKİMYA KONGRESİ 3-6 KASIM 2015 ANTALYA Lymphocyte Function Associated Antigen 1 / Lökosit Fonksiyon İlişkili Antijen-1(LFA-1) Antijen spesifik cevaplar Lenfosit tarafından hedeflenme İnflamasyon bölgelerinde monosit ve nötrofil diapedezi LFA-1 I domeini JAM-A için fonksiyonel bir bağlanma bölgesi içermektedir. JAM-A membran proksimal Ig domein 2 (D2) LFA-1 I domeini XXVII. ULUSAL BİYOKİMYA KONGRESİ JAM-A homodimeri JAM-A / LFA bağlanması 3-6 KASIM 2015 ANTALYA AMAÇ Çalışmamızda tümör hücrelerinin ekstravazasyonunda rol oynayan JAM-A ve LFA-1 hücre adhezyon moleküllerindeki JAM-A rs790056 ve LFA-1 rs8058823 ve LFA-1 rs2230433 gen varyasyonlarının meme kanseri riskine etkisinin belirlenmesi amaçlanmıştır. JAM-A rs790056 LFA-1 rs8058823 LFA-1 rs2230433 XXVII. ULUSAL BİYOKİMYA KONGRESİ Minör Allel C A C Majör Allel T G G 3-6 KASIM 2015 ANTALYA YÖNTEM İÜ Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Genel Cerrahi AD’da takip edilen PCR-RFLP (Fu et al., 2011) 108-meme kanseri hastası kadın 63-sağlıklı kadın JAM-A rs790056 (int6 T>C) LFA-1 rs8058823 (3’UTR A>G) LFA-1 rs2230433 (8ex21 2120 G>C) Verilerin analizi SPSS-21.0 istatistik programı (p<0.05) Haploview programı XXVII. ULUSAL BİYOKİMYA KONGRESİ 3-6 KASIM 2015 ANTALYA BULGULAR XXVII. ULUSAL BİYOKİMYA KONGRESİ 3-6 KASIM 2015 ANTALYA Tablo 1. Hastaların Karakteristik Özellikleri Hasta Karakteristiği Menopoz durumu Histolojik derecesi Östrojen Reseptör durumu Progesteron Reseptör durumu Lenfatik vasküler invazyon In situ komponent Perinöral invazyon Nekroz Kanser tipi c-erb anlatımı XXVII. ULUSAL BİYOKİMYA KONGRESİ PrePostErken (1,2) Geç (3) ER(-) ER(+) PR(-) PR(+) Hayır Evet Hayır Evet Hayır Evet Hayır Evet Invasif duktal Diğer Hayır Evet n (%) 45 (49.5) 46 (50.5) 35 (56.5) 27 (43.5) 23 (30.3) 53 (69.7) 37 (48.7) 39 (51.3) 29 (54.7) 24 (45.3) 13 (26.0) 37 (74.0) 35 (68.6) 16 (31.4) 24 (48.0) 26 (52.0) 69 (87.3) 10 (12.7) 33 (44.6) 41 (55.4) 3-6 KASIM 2015 ANTALYA Tablo 2. Çalışma Gruplarında JAM-A ve LFAGenotiplerinin Dağılımı Kontrol (n=63) Gruplar Hasta (n=108) JAM-A rs790056 Genotipi TT39 (61.9%) CC8 (12.7%) TC16 (25.4%) 69 (63.9%) 9 (8.3%) 30 (27.8%) JAM-A rs790056 Allelleri T94 (74.60%) C32 (25.40%) 168 (77.78%) 48 (22.22%) LFA-1 rs8058823 Genotipi AA40 (63.5%) GG7 (11.1%) AG16 (25.4%) 87 (80.6%) * 21 (19.4%) *, p=0.014 **, p=0.001 (Fisher’s exact test) ***, p=0.048 (Fisher’s exact test) LFA-1 rs8058823 Allelleri A96 (76.19%) G30 (23.81%) 195 (90.28%) ** 21 (9.72%) LFA-1 rs2230433 Genotipi CC16 (25.4%) GG GC47 (74.6%) 21 (19.4%) 7 (6.5%) *** 80 (74.1%) LFA-1 rs2230433 Allelleri C79 (62.70%) G47 (37.30%) XXVII. ULUSAL BİYOKİMYA KONGRESİ 122 (56.48%) 94 (43.52%) 3-6 KASIM 2015 ANTALYA Tablo 3. Çalışma Gruplarında JAM-A rs790056 (T>C), LFA-1 rs8058823 (A>G) ve LFA-1 rs2230433 (C>G) İkili Allel Haplotip Setlerinin Frekansları Haplotip Toplam Frekanslar Meme kanseri Kontrol Ki kare p değeri JAM-A rs790056 ve LFA-1 rs8058823 TA CA TG CG 0.666 0.182 0.100 0.052 0.713 0.185 0.065 0.037 0.587 0.175 0.159 0.079 5.667 0.058 7.847 2.852 0.0173 0.8095 0.0051 0.0913 JAM-A rs790056 ve LFA-1 rs2230433 TC TG CC CG 0.441 0.325 0.147 0.087 0.437 0.341 0.128 0.094 0.448 0.298 0.179 0.075 0.04 0.669 4.652 0.369 0.8405 0.4134 0,1986 0,5435 LFA-1 rs2230433 ve LFA-1 rs8058823 CA GA CG GG 0.462 0.386 0.126 0.026 0.482 0.417 0.083 0.019 0.429 0.333 0.198 0.040 0.896 2.332 9.59 1.389 0.3439 0.1267 0.002 0.2386 XXVII. ULUSAL BİYOKİMYA KONGRESİ 3-6 KASIM 2015 ANTALYA Tablo 4. Çalışma Gruplarında JAM-A rs790056, LFA1 rs2230433 ve LFA-1 rs8058823 Üçlü Allel Haplotip Setlerinin Frekansları Haplotip Frekanslar Toplam Meme Kontrol Ki kare p değeri kanseri (JAM-A rs790056, LFA-1 rs2230433, LFA-1 rs8058823) TCA TGA CCA TCG CGA CCG CGG XXVII. ULUSAL BİYOKİMYA KONGRESİ 0.352 0.313 0.109 0.091 0.074 0.036 0.016 0.377 0.336 0.104 0.060 0.082 0.024 0.012 0.311 0.274 0.116 0.144 0.060 0.056 0.021 1.511 1.391 0.128 6.711 0.54 2.365 0.406 0.2189 0.2383 0.7207 0.0096 0.4622 0.1241 0.524 3-6 KASIM 2015 ANTALYA BULGULAR LFA-1 rs8058823 AA genotipi (p=0.014) ve A allel frekansı (p=0.001) ve LFA-1 rs2230433 GG genotip frekansı (p=0.048) hastalarda kontrol grubuna göre yüksektir. Haplotip analizinde TA haplotip (JAM-A rs790056 T alleli - LFA1 rs8058823 A alleli) frekansı hasta grubunda kontrol grubuna göre yüksek iken (p=0.0173), TG haplotip (JAM-A rs790056 T alleli - LFA-1 rs8058823 G alleli) frekansı düşük (p=0.0051) gözlenmiştir. TCG haplotip (JAM-A rs790056 T alleli- LFA-1 rs2230433 C alleli - LFA-1 rs8058823 G alleli) frekansı hasta grubunda kontrol grubuna kıyasla düşüktür (p=0.0096). XXVII. ULUSAL BİYOKİMYA KONGRESİ 3-6 KASIM 2015 ANTALYA TARTIŞMA Çalışmamızda LFA-1 rs2230433 SNP için nadir GG genotipi ve G alleli ve rs8058823 SNP için normal AA genotipi ve A alleli vakalarda daha yüksektir. RİSK FAKTÖRÜ XXVII. ULUSAL BİYOKİMYA KONGRESİ 3-6 KASIM 2015 ANTALYA TARTIŞMA Çin Han populasyonunda LFA-1 polimorfizmlerinin incelendiği araştırmada (Fu et al, 2011) rs2230433 SNP için GG genotipi ve G alleli ve rs8058823 SNP için AA genotipi ve A alleli vakalarda daha düşüktür. KORUYUCU rs2230433 CG genotipi ile rs8058823 AG genotipi ise vakalarda daha yüksektir. XXVII. ULUSAL BİYOKİMYA KONGRESİ 3-6 KASIM 2015 ANTALYA TARTIŞMA Çalışmamızda; LFA-1 rs8058823 nadir G allel frekansı (K: %23.81; H: %9.2) Çin, Güney Asya ve Avrupa populasyonlarında daha yüksek iken, Afrika populasyonlarına daha yakın, LFA-1 rs2230423 nadir G allel frekansı (K: %37.3; H: 43.52) ise Avrupa, Afrika ve Çin populasyonlarında daha düşük iken, Güney Asya populasyonlarına daha yakın olarak belirlenmiştir. Etnik köken, Çevresel alt yapı, Diğer faktörler TARTIŞMA JAM-A rs790056 T alleli + LFA-1 rs8058823 A alleli meme kanseri riskini ↑ JAM-A rs790056 T alleli + LFA-1 rs8058823 G alleli meme kanseri riskini ↓ XXVII. ULUSAL BİYOKİMYA KONGRESİ 3-6 KASIM 2015 ANTALYA TEMEL LİMİTASYON Çalışma populasyonu görece küçük olduğundan LFA-1 rs8058823 ve LFA-1 rs2230433 SNPlerine ait nadir GG genotip frekansları da az gözlenmiştir (Tablo 2). Bu varyasyonların meme kanser hastalarında klinikopatolojik karakteristik alt gruplamaları üzerine etkisi istatistiksel olarak analiz edilememiştir. XXVII. ULUSAL BİYOKİMYA KONGRESİ 3-6 KASIM 2015 ANTALYA SONUÇ LFA-1 ve JAM-A gen varyasyonları meme kanser riski için kullanışlıdır. LFA-1 ve JAM-A genlerinin meme kanseri gelişiminde rol oynayan lökosit migrasyonu üzerine etkisi daha büyük örneklem grupları ve bu genlere ait daha fazla SNP ile araştırılmaya devam edilmelidir. XXVII. ULUSAL BİYOKİMYA KONGRESİ 3-6 KASIM 2015 ANTALYA DİNLEDİĞİNİZ İÇİN TEŞEKKÜRLER XXVII. ULUSAL BİYOKİMYA KONGRESİ 3-6 KASIM 2015 ANTALYA