BİYOİSTATİSTİK TEZLİ YÜKSEK LİSANS DERSLERİ Ders Kod
Transkript
BİYOİSTATİSTİK TEZLİ YÜKSEK LİSANS DERSLERİ Ders Kod
BİYOİSTATİSTİK TEZLİ YÜKSEK LİSANS DERSLERİ Ders Kod. Dersin Adı Dersin Teorik Uygulama Toplam Türü TIBBİ ARAŞTIRMALARDA VERİ ANALİZİ I Zorunlu TIBBİ ARAŞTIRMALARDA VERİ ANALİZİ II Zorunlu ÖRNEKLEME YÖNTEMLERİ Seçmeli MATEMATİKSEL İSTATİSTİK Seçmeli PARAMETRİK OLMAYAN İSTATİSTİK Seçmeli YÖNTEMLER STOKASTİK SÜREÇLER Seçmeli DENEME TASARIMI VE ANALİZİ Seçmeli ÇOK DEĞİŞKENLİ İSTATİSTİKSEL Seçmeli YÖNTEMLER REGRESYON ANALİZİ I Seçmeli REGRESYON ANALİZİ II Seçmeli KLİNİK DENEMELER Seçmeli UYGULAMALI KATAGORİK VERİ ANALİZİ Seçmeli SAĞLIK ALANINDA ÖZEL İSTATİSTİK Seçmeli YÖNTEMLER RANDOMİZE KONTROLLÜ KLİNİK Seçmeli DENEMELER BİYOİNFORMATİK Seçmeli VERİ YÖNETİMİ Seçmeli GENETİK Seçmeli POPULASYON GENETİĞİ Seçmeli DOĞRUSAL CEBİR Seçmeli Seminer Ulusal ECTS Saat 4 4 2 2 2 Kredi 3 3 2 2 2 7,5 7,5 7,5 7,5 7,5 2 2 2 2 2 2 2 2 2 7,5 7,5 7,5 3 3 2 2 2 3 3 2 2 2 3 3 2 2 2 7,5 7,5 7,5 7,5 7,5 2 2 2 7,5 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 7,5 7,5 7,5 7,5 7,5 7,5 Saat 2 2 2 2 2 Saat 2 2 TIBBİ ARAŞTIRMALARDA VERİ ANALİZİ I …… ECTS Kredisi 1.yıl – 1. yarıyıl Ders verme: 2 saat/hafta 4 saat/hafta Uygulama : 2 saat/hafta Öğretim Üyesi: Prof. Dr. Mehmet N. ORMAN Prof. Dr. Soner DUMAN Yrd. Doç. Dr. Timur KÖSE Öğr. Gör. A. Murat ERGİN Yüksek Lisans Zorunlu/Seçmeli Türkçe Dersin Amacı ve Hedefi Bu derste 3 amaç hedeflenmiştir. 1. Sahada veri toplama, Simülasyonla veri elde etme ve toplanan verilerin analizini yapabilme becerisini kazanmak 2. Sorunlu çalışmaların veri yapılarını değerlendirme ve analizlerini yapabilme bilgi ve deneyimini kazanmak. 3. Yaygın olarak kullanılan istatistik paket programlarını tanımak ve kullanabilmek. Dersin İçeriği Temel istatistik kavramlar, Veri yapıları, Özet tablolar ve grafikler, Frekans tabloları ve özet istatistikler, Örnekleme, Olasılık ve temel kavramları, Hipotez testlerine giriş, Tek ve iki örneklem testleri, güven aralıkları, Regresyon, Korelasyon analizi Dersin Değerlendirilmesi Aktif öğrenmeye ve tartışmaya katılım, ödev, sunum ve sınavlardan oluşur. Dönem içi sınav, aktif katılım, sunum toplam değerlendirmesi %40, ve bir yazılı yarıyıl sonu sınavı (%60) yapılmaktadır. Önşart/Önerilen Ders Kitabı/Diğer Materyal Rostner, B. “Fundementals of Biostatistics” 5th Ed. Duxbury press, USA, 2000 Munro, BH. “Statistical Methods for Health Care Research” 4th Ed. Lippincott press, USA, 2001. İkiz, F., Püskülcü, H., Eren, Ş. “İstatistiğe Giriş“ Fakülteler Kitapevi, 2006. TIBBİ ARAŞTIRMALARDA VERİ ANALİZİ II ………. ECTS Kredisi 1.yıl – 1. yarıyıl Ders verme: 2 saat/hafta 4 saat/hafta Uygulama : 2 saat/hafta Öğretim Üyesi: Prof. Dr. Mehmet N. ORMAN Prof. Dr. Soner DUMAN Yrd. Doç. Dr. Timur KÖSE Öğr. Gör. A. Murat ERGİN Yüksek Lisans Zorunlu/Seçmeli Türkçe Dersin Amacı ve Hedefi Bu derste 3 amaç hedeflenmiştir. 4. Sahada veri toplama, Simülasyonla veri elde etme ve toplanan verilerin analizini yapabilme becerisini kazanmak 5. Sorunlu çalışmaların veri yapılarını değerlendirme ve analizlerini yapabilme bilgi ve deneyimini kazanmak. 6. Yaygın olarak kullanılan istatistik paket programlarını tanımak ve kullanabilmek. Dersin İçeriği Hipotez kontrolleri, 2 den fazla örneklem testleri, 2 yönlü varyans analizi, ki kare analizi, Risk ölçütleri, klinik denemelerde örneklem büyüklüğü belirlenmesinde temel yaklaşımlar. Dersin Değerlendirilmesi Aktif öğrenmeye ve tartışmaya katılım, ödev, sunum ve sınavlardan oluşur. Dönem içi sınav, aktif katılım, sunum toplam değerlendirmesi %40, ve bir yazılı yarıyıl sonu sınavı (%60) yapılmaktadır. Önşart/Önerilen Ders Kitabı/Diğer Materyal Rostner, B. “Fundamentals of Biostatistics” 5th Ed. Duxbury press, USA, 2000. Munro, BH. “Statistical Methods for Health Care Research” 4th Ed. Lippincott press, USA, 2001. İkiz, F., Püskülcü, H., Eren, Ş. “İstatistiğe Giriş“ Fakülteler Kitapevi, 2006. ÖRNEKLEME YÖNTEMLERİ ……. ECTS Kredisi 2 saat/hafta 1.yıl – 1. yarıyıl Ders verme: 2 saat/hafta Uygulama : - Yüksek Lisans Zorunlu/Seçmeli Türkçe Öğretim Üyesi: Prof. Dr. Mehmet N. ORMAN Yrd. Doç. Dr. Timur KÖSE Dersin Amacı ve Hedefi Örnekleme yöntemlerini kavramak ve bunları araştırmalarda kullanabilme deneyimini elde etmek. Ayrıca örnekleme yöntemlerine göre uygun örneklem büyüklüğünü belirleyebilme becerisini kazanmak. Dersin İçeriği Olasılıksız, olasılıklı örnekleme, basit rasgele, tabakalı, küme, ardışık, çok dereceli, sistematik örnekleme. Dersin Değerlendirilmesi Aktif öğrenmeye ve tartışmaya katılım, ödev, sunum ve sınavlardan oluşur. Dönem içi sınav, aktif katılım, sunum toplam değerlendirmesi %40, ve bir yazılı yarıyıl sonu sınavı (%60) yapılmaktadır. Önşart/Önerilen Ders Kitabı/Diğer Materyal - Kish, L. “Survey Sampling” John Wiley and Sons, USA, 1967. - Cochran WG. “Sampling Techniques” 3rd ed, John Wiley and Sons, USA, 1977. - Sümbüloğlu, V., Sümbüloğlu K. “Klinik ve Saha Araştırmalarında Örnekleme ve Örneklem Büyüklüğü” Alp Ofset Baskı, Ankara, 2005. - Thompson, WL. “Sampling Rare or Elusive Species : Concepts, Designs, and Techniques for Estimating Population Parameters” Island Press, USA, 2004. MATEMATİKSEL İSTATİSTİK …….. ECTS Kredisi 2 saat/hafta 1.yıl – 1. yarıyıl Ders verme: 2 saat/hafta Uygulama : - Yüksek Lisans Zorunlu/Seçmeli Türkçe Öğretim Üyesi: Prof. Dr. Mehmet N. ORMAN Dersin Amacı ve Hedefi Rastsal değişken, beklenen değer, olasılık, olasılık yoğunluk fonksiyonları gibi konularda Matematiksel istatistik teorilerini kavranmasını sağlamak ve bu kavramların uygulamadaki yerini göstermek. Dersin İçeriği Olasılık, Rastsal değişkenler, Momentler, kesikli ve sürekli dağılımlar, dağılımlar arası ilişkiler, yeterli istatistikler, beklenen değer kavramı. Dersin Değerlendirilmesi Aktif öğrenmeye ve tartışmaya katılım, ödev, sunum ve sınavlardan oluşur. Dönem içi sınav, aktif katılım, sunum toplam değerlendirmesi %40, ve bir yazılı yarıyıl sonu sınavı (%60) yapılmaktadır. Önşart/Önerilen Ders Kitabı/Diğer Materyal - Hogg, RV., Craif, AT. “Introduction to Mathematical Statistics” 4th Ed. Macmillan Publishind, USA, 1978. - Roussas, GG. “ A First Course in Mathematical Statistics”, Addison-Wesley Publishing, USA, 1973. - Aytaç, M. “Matematiksel İstatistik”, Ezgi yayınları, Bursa, 1999. - Freund, JE. “ Mathematical Statistics” Prentice Hall, 2nd Ed. Uk, 1972. - Fienberg, S.. Casella, G.. Olkin, I. “Mathematical Statistics : A Unified Introduction” Springer-Verlag, NY, 1999. PARAMETRİK OLMAYAN İSTATİSTİK YÖNTEMLER ………. ECTS Kredisi 1.yıl – 1. yarıyıl Ders verme: 2 saat/hafta 2 saat/hafta Uygulama : Öğretim Üyesi: Prof. Dr. Mehmet N. ORMAN Yüksek Lisans Zorunlu/Seçmeli Türkçe Dersin Amacı ve Hedefi Parametrik olmayan istatistik metotlarını tanımak, kavramak ve uygulayabilme bilgi ve becerisine sahip olmak. Dersin İçeriği Tek örneklem, bağlantılı çift örneklem, bağlantısız çift örneklem, bağlantılı k örneklem, bağlantısız k örneklem veri yapılarında kullanılan parametrik olmayan analiz yöntemleri ve hipotez testleri, Dersin Değerlendirilmesi Aktif öğrenmeye ve tartışmaya katılım, ödev, sunum ve sınavlardan oluşur. Dönem içi sınav, aktif katılım, sunum toplam değerlendirmesi %40, ve bir yazılı yarıyıl sonu sınavı (%60) yapılmaktadır. Önşart/Önerilen Ders Kitabı/Diğer Materyal - Conover WJ. “Practical Nonparametric Statistics” 2 nd Ed. John Wiley and Sons, USA 1980. STOKASTİK SÜREÇLER …….. ECTS Kredisi 2 saat/hafta 1.yıl – 1. yarıyıl Ders verme: 2 saat/hafta Uygulama : - Yüksek Lisans Zorunlu/Seçmeli Türkçe Öğretim Üyesi: Yrd. Doç. Dr. Timur KÖSE Dersin Amacı ve Hedefi Kesikli ve sürekli zaman içinde şansa bağlı olarak oluşan olayların genel olarak analizini yapabilmek için gerekli teoriyi tanıtmak ve statik dinamik modellerin istatistik analizlerinin gerçekleştirilmesi ile öğrencilerin sistemleri genel olarak çözümleyebilme yeteneğinin kazanmalarını sağlamaktır. Dersin İçeriği 7. Giriş, genel bilgiler ve tanımlar. 8. Sans yürüyüşleri 1. Basit şans yürüyüşü 2. Tutucu sınırlar arasında basit şans yürüyüşü 3. Yansıtıcı sınırlar arasında basit şans yürüyüşü 4. Basit şans yürüyüşünün difüzyonu 9. Dallanma süreci 0. Örnekler 1. Temel Teori 10. Markov zincirleri 0. Temel teori 1. Bitimli zincirlerin cebirsel çözümleri 2. Konumların sınıflandırılması 11. Sürekli zaman süreçleri 0. Poisson süreci 1. Doğun-Ölüm süreci 2. Kuyruk teorisi Dersin Değerlendirilmesi Aktif öğrenmeye ve tartışmaya katılım, ödev, sunum ve sınavlardan oluşur. Dönem içi sınav, aktif katılım, sunum toplam değerlendirmesi %50, ve bir yazılı yarıyıl sonu sınavı (%50) yapılmaktadır. Önşart/Önerilen Ders Kitabı/Diğer Materyal -Wolff, RW. “Stochastic Modeling and the Theory of Queues” Prentice Hall editions, USA, 1989. -Parzen, E. “Stochastic Processes”, Holden Day Inc., USA, 1964. -Cox, DR., Miller, HD. “The Theory of Stochastic Processes” Chapman and Hall, UK, 1972. - Chang, Fwu-R. “Stochastic Optimization in Continuous Time” Cambridge University Press, UK, 2004. - Lindsey, JK., Gill, R., Ripley, BD. “Statistical Analysis of Stochastic Processes in Time” Cambridge University Press, UK, 2004. DENEME TASARIMI VE ANALİZİ ……. ECTS Kredisi 2 saat/hafta 1.yıl – 1. yarıyıl Ders verme: 2 saat/hafta Uygulama : - Yüksek Lisans Zorunlu/Seçmeli Türkçe Öğretim Üyesi: Yrd. Doç. Dr. Timur KÖSE Prof. Dr. Mehmet N. ORMAN Dersin Amacı ve Hedefi Bu derste, araştırma-geliştirme faaliyetleri için gerekli bilimsel yaklaşımlar tanıtılmakta, istatistik metodoloji ve modellemenin temel prensipleri incelenmektedir. Dersin İçeriği Bilgi üretimi ve problem çözmenin temel dayanakları. Bilimsel yöntem ve araştırma tanımları. Araştırma süreci ve modelleri. Temel istatistik prensipler. Genel Doğrusal model ve çözümlemesi Deneme modelleri ve temel deneme planları. Faktöriyel deneme modelleri. Dersin Değerlendirilmesi Dönem içinde bir arasınav, bir de yarıyılsonu sınavı yapılmaktadır. Arasınav notunun %40'ı ve yarıyılsonu sınavının %60'ı sonuç notunu oluşturmaktadır. Önşart/Önerilen Ders Kitabı/Diğer Materyal Mead, R., Curnow, R.N., and Hosted, A. "Statistical Methods in Agriculture and Experimental Biology", Chapman&Hall London, 1983. Whitehead, J. The Design and Analysis of Sequential Trials. John Wiley. NY, 1997. Mead,R. The Design of Experiments. Statistical principles for practical application. Cambridge Univ. Pres.Cambridge. 1990. ÇOK DEĞİŞKENLİ İSTATİSTİKSEL YÖNTEMLER …….. ECTS Kredisi 1.yıl – 1. yarıyıl Ders verme: 2 saat/hafta 2 saat/hafta Uygulama : Öğretim Üyesi: Prof. Dr. Mehmet N. ORMAN Yrd. Doç. Dr. Timur KÖSE Yüksek Lisans Zorunlu/Seçmeli Türkçe Dersin Amacı ve Hedefi Öğrencilerin Çok değişkenli istatistik yöntemlerini tanımak ve uygulayabilme bilgi ve becerisine sahip olması hedeflenmektedir. Dersin İçeriği Matris kavramı, çok değişkenli normal dağılış, çok değişkenli ortalamalar ve doğrusal modellerde çıkarsamalar, temel bileşenler analizi, faktör analizi, diskriminant analizi, kümeleme analizi Dersin Değerlendirilmesi Aktif öğrenmeye ve tartışmaya katılım, ödev, sunum ve sınavlardan oluşur. Dönem içi sınav, aktif katılım, sunum toplam değerlendirmesi %50, ve bir yazılı yarıyıl sonu sınavı (%50) yapılmaktadır. Önşart/Önerilen Ders Kitabı/Diğer Materyal Johnson, RA, Wichern, DW, “Applied Multivariate statistical Analysis” Prentice Hall press, USA, 1982. Brenner, D., Fienberg, S., Casella, G. “Theory of Multivariate Statistics” Springer-Verlag, USA, 1999. Timm, NH. “Applied Multivariate Analysis” Springer-Verlag, USA, 2002. REGRESYON ANALİZİ I ………. ECTS Kredisi 2 saat/hafta 1.yıl – 1. yarıyıl Ders verme: 2 saat/hafta Uygulama : - Yüksek Lisans Zorunlu/Seçmeli Türkçe Öğretim Üyesi: Yrd. Doç. Dr. Timur KÖSE Dersin Amacı ve Hedefi Basit ve çoklu doğrusal regresyon analizi yöntemini tanıtmak ve yöntemi uygun şekilde kullanma yetisini kazandırmak. Sağlık alanına özel veri setlerinde bilgisayar destekli uygulamalar ile regresyon analizi sonuçlarını yorumlama bilgisine sahip olması hedeflenmektedir. Dersin İçeriği Basit doğrusal regresyon analizi; model uyumu ve uyum yetmezliği testi; matris çözümlemesi; artıkların incelenmesi; çoklu doğrusal regresyon analizi; çoklu doğrusal regresyon analizinde model seçme yöntemleri. Dersin Değerlendirilmesi Aktif öğrenmeye ve tartışmaya katılım, ödev, sunum ve sınavlardan oluşur. Dönem içi sınav, aktif katılım, sunum toplam değerlendirmesi %40, ve bir yazılı yarıyıl sonu sınavı (%60) yapılmaktadır. Önşart/Önerilen Ders Kitabı/Diğer Materyal Draper, NR, Smith, H. “Applied Regresyon Analysis” 2nd Ed. Wiley pres, USA, 1981 Qiu, P. “Image Processing and Jump Regression Analysis” John Wiley & Sons, USA, 2005. Rawlings, JO., Dickey, DA., Pantula, SG. “Applied Regression Analysis : A Research Tool” Springer-Verlag, NY, 1998. REGRESYON ANALİZİ II ………. ECTS Kredisi 2 saat/hafta 1.yıl – 1. yarıyıl Ders verme: 2 saat/hafta Uygulama : - Yüksek Lisans Zorunlu/Seçmeli Türkçe Öğretim Üyesi: Prof. Dr. Mehmet N. ORMAN Dersin Amacı ve Hedefi Dönüşümlü doğrusal regresyon ve doğrusal olmayan regresyon analizi yöntemini tanıtmak ve yöntemi uygun şekilde kullanma yetisini kazandırmak. Sağlık alanına özel veri setlerinde bilgisayar destekli uygulamalar ile regresyon analizi sonuçlarını yorumlama bilgisine sahip olması hedeflenmektedir. Dersin İçeriği Doğrusal hale dönüştürme yöntemleri; tek ve çoklu doğrusal olmayan modeller; iteratif (döngüsel) parametre tahmin yöntemleri Dersin Değerlendirilmesi Aktif öğrenmeye ve tartışmaya katılım, ödev, sunum ve sınavlardan oluşur. Dönem içi sınav, aktif katılım, sunum toplam değerlendirmesi %40, ve bir yazılı yarıyıl sonu sınavı (%60) yapılmaktadır. Önşart/Önerilen Ders Kitabı/Diğer Materyal - Draper, NR, Smith, H. “Applied Regresyon Analysis” 2nd Ed. John Wiley, USA, 1981. - Gallant, AR., “Nonlinear Statistical Models”, John Willey, USA, 1987 KLİNİK DENEMELER …….. ECTS Kredisi 2 saat/hafta 1.yıl – 1. yarıyıl Ders verme: 2 saat/hafta Uygulama : - Yüksek Lisans Zorunlu/Seçmeli Türkçe Öğretim Üyesi: Prof. Dr. Mehmet N. ORMAN Prof. Dr. Soner DUMAN Yrd. Doç. Dr. Timur KÖSE Dersin Amacı ve Hedefi Öğrencilerin, klinik araştırmayı planlama aşamasından raporlama aşamasına kadar tüm aşamalarda istatistik analiz ve değerlendirme bilgi ve becerisini kazandırmak. Dersin İçeriği Tanımlamalar, klinik araştırma modelleri ve analizi, klinik deneme evreleri, Klinik araştırma uygulama yönergeleri, Klinik araştırma protokolü ve hazırlanması, körleme, rasgelelik, yanlılık. Dersin Değerlendirilmesi Aktif öğrenmeye ve tartışmaya katılım, ödev, sunum ve sınavlardan oluşur. Dönem içi sınav, aktif katılım, sunum toplam değerlendirmesi %40, ve bir yazılı yarıyıl sonu sınavı (%60) yapılmaktadır. Önşart/Önerilen Ders Kitabı/Diğer Materyal Everitt, BS, Pickles, A. “Statistical Aspects of the Design and Analysis of Clinical Trials”, Revised Edition, Imperial College Press, USA 2004. Flather, M, Aston, H. “Stables, Rod Handbook of Clinical Trials” Remedica, USA, 2001 Gastl, G., Berdel, W., Edler, L. “Standard Operating Procedures for Clinical Trials of the Central European Society for Anticancer Drug Research” Karger Publishers, USA, 2003. UYGULAMALI KATAGORİK VERİ ANALİZİ ……… ECTS Kredisi 1.yıl – 1. yarıyıl Ders verme: 2 saat/hafta 2 saat/hafta Uygulama : Öğretim Üyesi: Prof. Dr. Mehmet N. ORMAN Yrd. Doç. Dr. Timur KÖSE Yüksek Lisans Zorunlu/Seçmeli Türkçe Dersin Amacı ve Hedefi Çok boyutlu çapraz tabloları değerlendirebilecek ve istatistik paket programları yardımıyla analiz ve yorum yapabilecek bilgi ve deneyim kazandırmak. Dersin İçeriği Modelleme, model seçimi, uyum iyiliği testleri, parametre tahminleri, ilişki ölçütleri, önem düzeyleri ve önemlilik kaynaklarının belirlenmesi. Dersin Değerlendirilmesi Aktif öğrenmeye ve tartışmaya katılım, ödev, sunum ve sınavlardan oluşur. Dönem içi sınav, aktif katılım, sunum toplam değerlendirmesi %40, ve bir yazılı yarıyıl sonu sınavı (%60) yapılmaktadır. Önşart/Önerilen Ders Kitabı/Diğer Materyal -Fleiss, JL. “Statistical Methods for Rates and Proportions”, 2nd Ed. John Wiley and Sons Series, USA, 1981. -Everitt, BS. “The Analysis of Contingency Tables”, Chapman and Hall Ltd, UK, 1980. SAĞLIK ALANINDA ÖZEL İSTATİSTİK YÖNTEMLER ……. ECTS Kredisi 1.yıl – 1. yarıyıl Ders verme: 2 saat/hafta 2 saat/hafta Uygulama : Öğretim Üyesi: Prof. Dr. Mehmet N. ORMAN Yrd. Doç. Dr. Timur KÖSE Yüksek Lisans Zorunlu/Seçmeli Türkçe Dersin Amacı ve Hedefi Sağlık alanında kullanılan özel bazı istatistiksel yöntemlerin teorik altyapısı ile birlikte uygulamasını kavramak bilgi ve becerisine sahip olmak. Dersin İçeriği Meta analizi, Yaşam analizi, Cox regresyon, Probit analizi, Logistik regresyon analizi, Loglinear modeller. Dersin Değerlendirilmesi Aktif öğrenmeye ve tartışmaya katılım, ödev, sunum ve sınavlardan oluşur. Dönem içi sınav, aktif katılım, sunum toplam değerlendirmesi %40, ve bir yazılı yarıyıl sonu sınavı (%60) yapılmaktadır. Önşart/Önerilen Ders Kitabı/Diğer Materyal - Fleiss, JL. “Statistical Methods for Rates and Proportions”, 2nd Ed. John Wiley and Sons Series, USA, 1981. - Everitt, BS. “The Analysis of Contingency Tables”, Chapman and Hall Ltd, UK, 1980. - Rothman, KJ., Greenlang, S. “Modern Epidemiology” 2nd Ed., Lippincott Williams and Wilkins, USA, 1998. - Everitt, BS., Pickles, A. “Statistical Aspects od the Design and Analysis of Clinical Trials” Imperial College Press, USA, 2004. (http://site.ebrary.com/lib/doc?id=10082180) - Christensen, R. “Log-Linear Models & Logistic Regression” Springer-Verlag NY, 1997. RANDOMİZE KONTROLLÜ KLİNİK DENEMELER …….. ECTS Kredisi 1.yıl – 1. yarıyıl Ders verme: 2 saat/hafta 2 saat/hafta Uygulama : Öğretim Üyesi: Yrd. Doç. Dr. Timur KÖSE Dersin İçeriği Randomize Kontrollü Klinik Denemeler (2+0) Randomize Kontrollü Deneme Nedir? Yanlılık ve Türleri Deney İçin Gerekli Hasta Sayısı Hastaların Guruplara Atanması Körleme Sonuçların Analizi Binary ve Sağkalım Verilerinin Analizi Ardışık Deney Tasarımları Alt Gurupların Kıyaslanması Protokoller ve Protokolden Sapmalar Cross-Over Denemeler Meta Analizi Yüksek Lisans Zorunlu/Seçmeli Türkçe Ders Kitabı: Intoduction to Randomized Controlled Clinical Trials. JNS Mathews, (2006), Chapman and Hall. 1- Armitge, P. and J.N.S. Mathews. (2002). Statistical Methods Diğer Yardımcı Kitaplar: in Medical Research, 4. Ed. Blackwell 2- Whitehead, J. (1992). The Design and Analysis of Sequential Clinical Trials. Ellis Horwood. BİYOİNFORMATİK …….. ECTS Kredisi 2 saat/hafta 1.yıl – 1. yarıyıl Ders verme: 2 saat/hafta Uygulama : - Yüksek Lisans Zorunlu/Seçmeli Türkçe Öğretim Üyesi: Prof. Dr. Kemal Sami KORKMAZ Dersin Amacı ve Hedefi Dersin amacı Biyoistatistik ve Medikal İnformatik Yüksek Lisans öğrencilerine informatik uygulamaların moleküler biyoloji boyutu ile ilgili teorik ve pratik kavramları aktarmaktır. Bu ders ile öğrencilerin veri bankalarındaki çok miktardaki verilerin analizlerine yaklaşımlar sağlamaları amaçlanmıştır. Dersin İçeriği o o o o o o Temel biyolojik kavramlar Biyoinformatiğin biyolojideki yeri ve önemi Biyoinformatik veribankaları, deposituvarlar (NCBI, EMBL, Refseq, Genbank, PDB, SwissProt) Biyolojik veriler (örneğin; insan genomu, protein yapıları) ve bu verilerin yaşam bilimciler tarafından nasıl kullanıldığı Hücreler kullanılarak çoklu veri üreten sistemler Veri çeşitleri ve analizi Dersin Değerlendirilmesi Bir yarıyılda bir yazılı ara sınav (%40) ve bir yazılı yarıyıl sonu sınavı (%60) yapılmaktadır Önşart/Önerilen Bu dersi alacak öğrencilerin Temel biyoloji, (DNA, RNA gibi) ve/veya moleküler biyoloji kavramlarına birikimli olmak onerilmektedir. Ders Kitabı/Diğer Materyal NCBI database site http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gquery/gquery.fcgi PDB database site http://www.rcsb.org/pdb/ VERİ YÖNETİMİ …… ECTS Kredisi 2 saat/hafta 1.yıl – 1. yarıyıl Ders verme: 2 saat/hafta Uygulama : - Yüksek Lisans Zorunlu/Seçmeli Türkçe Öğretim Üyesi: Prof. Dr. Mustafa İNCEOĞLU Öğr. Gör. A. Murat ERGİN Dersin Amacı ve Hedefi Bu dersin amacı, öğrencilerin standart ve teknoloji tabanlı veri yönetim sistemlerinin anlaşılmasını sağlamaktır. Dersin İçeriği Veri İşleme Sistemleri Veri Tabanı İşleme Veri Tabanı İşlemlerinin Bileşenleri Sorgulama Dilleri: SQL Veri Tabanı Yönetim Sistemleri (ACCESS, SQL SERVER, ORACLE) Genişletilebilir İşaretleme Dili (XML) Dersin Değerlendirilmesi Beş adet 15-dakikalık küçük sınav, bir adet 2-saatlik vize ve 1 ödev planlanmıştır. Dönem sonunda 2-saatlik bir yılsonu sınavı planlanmıştır. Dönem içi %40, Dönem sonu %60 ağırlıklıdır. Önşart/Önerilen Ders Kitabı/Diğer Materyal Watson, Richard T., “Data Management: Databases & Organizations”, Wiley, 5th ed., (2005). Viescas J., Conrad J., “Microsoft Office Access(TM) 2007 Inside Out (Microsoft Office Access Inside Out)”, Microsoft Press, (2007). GENETİK …….. ECTS Kredisi 2 saat/hafta 1.yıl – 1. yarıyıl Ders verme: 2 saat/hafta Uygulama : - Yüksek Lisans Zorunlu/Seçmeli Türkçe Öğretim Üyesi: Prof. Dr. Güldehen BİLGEN Dersin Amacı ve Hedefi Temel ve moleküler düzeyde genetiğe ilişkin konularda bilgi birikimini aktarmak. Dersin İçeriği Nükleik asitlerin yapı ve özellikleri, prokaryot ve ökaryotlarda genetik materyalin organizasyonu, gen ekspresyonu, prokaryot ve ökaryotlarda gen anlatımının düzenlenmesi, Mendel kalıtımı, Mendel’den sapma gösteren faktörler, eşey ve eşeye bağlı kalıtım, mutasyonlar, gen maniplasyonları ve genomik analiz. Dersin Değerlendirilmesi Dönem içinde bir arasınav, bir de yarıyılsonu sınavı yapılmaktadır. Arasınav notunun %40'ı ve yarıyılsonu sınavının %60'ı sonuç notunu oluşturmaktadır. Önşart/Önerilen Ders Kitabı/Diğer Materyal Genetics, Peter J. Russell, 2002. Pearson Education, Inc. Principles of Genetics, Eldon J. Gardner, Michael J. Simmons, D. Peter Snustad, 1991.John Wiley and Sons, Inc. POPULASYON GENETİĞİ …….. ECTS Kredisi 2 saat/hafta 1.yıl – 1. yarıyıl Ders verme: 2 saat/hafta Uygulama : - Yüksek Lisans Zorunlu/Seçmeli Türkçe Öğretim Üyesi: Prof. Dr. Güldehen BİLGEN Dersin Amacı ve Hedefi Ders, populasyon düzeyinde genetik olayların temellerini içermektedir. Dersin İçeriği o o o o o o Populasyonun Genetik Yapısı: Genetik varyasyon, genetik varyasyonun ölçülmesi, gen ve genotip frekansları, HardyWeinberg dengesi Gen Frekansını Değiştiren Etmenler: Mutasyon, göç, seleksiyon, mutasyon ile seleksiyon arasındaki denge, rastgele sapma Varyanslar: Fenotipik ve genotipik varyans Kalıtım Derecesi: Önemi, özellikleri, tahmini Seleksiyon: Temel seleksiyon modeli, resesif ve dominantlara karşı seleksiyon İnsanla İlgili Populasyon Genetiği Kavramı: Genetik önerme, tek gen ve poligenik hastalıkların olasılığı, genetik hastalıkların oranı Dersin Değerlendirilmesi Dönem içinde bir arasınav, bir de yarıyılsonu sınavı yapılmaktadır. Arasınav notunun %40'ı ve yarıyılsonu sınavının %60'ı sonuç notunu oluşturmaktadır. Önşart/Önerilen Yok Ders Kitabı/Diğer Materyal - Genetics of Populations, P.H. Hedrick,1983,Jones and Bartlett Publishes, Inc. - Populasyon ve Biyometrik Genetik, Y. Vanlı, M. K. Özsoy, S. Baş,Yüzüncü Yıl Üniv. Ziraat Fak. Yardımcı Ders Kitapları Yayın no . 4. DOĞRUSAL CEBİR …….. ECTS Kredisi 3 saat/hafta 1.yıl – 1. yarıyıl Ders verme: 3 saat/hafta Uygulama : - Yüksek Lisans Zorunlu/Seçmeli Türkçe Öğretim Üyesi: Yrd. Doç. Vecdi AYTAÇ Dersin Amacı ve Hedefi Dersin amacı matris yaklaşımı ile lineer denklem sistemlerinin incelenmesi. Dersin İçeriği Lineer Eşitlikler, Lineer Sistemlerin Matris Kullanılarak Çözümü, Determinantlar, Matris ve Determinantlara İlişkin Diğer Özellikler, Vektörler, Lineer Denklem Sistemlerinin Çözümü ve Rank Kavramı, Eigen Değerleri ve Eigen Vektörleri Dersin Değerlendirilmesi Dönem içinde bir arasınav, bir de yarıyılsonu sınavı yapılmaktadır. Arasınav notunun %40'ı ve yarıyılsonu sınavının %60'ı sonuç notunu oluşturmaktadır. Önşart/Önerilen Yok Ders Kitabı/Diğer Materyal Eren Ş, Razbonyalı M, “Lineer Cebir”, Maltepe Üniversitesi, (2004) Kolman, B., Hill, D. R., “Introductory Linear Algebra with Applications”, Printice Hall, 7 Edition, (2001) Koç, C., “Basic Linear Algebra”, Matematik Vakfı, (1995) Anton, H.. Elementary Linear Algebra. 6th edition. John Wiley & Sons, Inc., (1991) Lang, S., “Linear Algebra”, Addison-Wesley Publishing Company, (1968) Lipschutz, S.,”Linear Algebra, Schaum’s Outline Series”, McGraw-Hill, Inc., (1974) Hoffman, K. M., Kunze R. A.,”Linear Algebra”, Printice Hall, 2 edition, (1971)