Doç. Dr. Cihan DARCAN - Bilecik Şeyh Edebali Üniversitesi Fen
Transkript
Doç. Dr. Cihan DARCAN - Bilecik Şeyh Edebali Üniversitesi Fen
BİLECİK ŞEYH EDEBALİ ÜNİVERSİTESİ AKADEMİK ÖZGEÇMİŞ FORMU Adı Soyadı KİŞİSEL BİLGİLER Cihan DARCAN Ünvanı Doç. Dr. Birimi Moleküler Biyoloji ve Genetik Doğum Yeri/Yılı E-Posta Domaniç/1975 cihan.darcan@bilecik.edu.tr Web Adresi EĞİTİM BİLGİLERİ Derecesi Lisans Bölüm/Program Biyoloji Bölümü Üniversite Yıl Eskişehir Osmangazi Üniversitesi Ondokuz Mayıs Üniversitesi Y. Lisans Fen Bilimleri Enstitüsü Biyoloji-Moleküler Biyoloji ABD Doktora / S.Yeterlilik Fen Bilimleri Enstitüsü Ondokuz Mayıs Biyoloji-Moleküler Biyoloji Üniversitesi ABD Doçentlik Bakteriyoloji ÜAK ALMIŞ OLDUĞU AKADEMİK VEYA İDARİ GÖREVLER Görev Ünvanı 1996 1999 2005 2013 Görev Yeri Yıl Sınıf Öğretmeni Biyolog Araştırma Görevlisi MEB 1996-1996 Diş Hekimliği Fakültesi-Ondokuz Mayıs Üniversitesi 1996-1998 Ondokuz Mayıs Üniv. Fen Edebiyat Fak. Biyoloji Böl. 1998-2005 Yrd. Doç. Dr. Moleküler Biyoloji ABD Dumlupınar Üniv. Fen Edebiyat Fak. Biyoloji Böl. 2005-2012 Yrd. Doç. Dr. Moleküler Biyoloji ABD Bilecik Şeyh Edebali Üniv. Fen Edebiyat Fak. 2012-2013 Doç. Dr. Moleküler Biyoloji ve Genetik Böl. Bilecik Şeyh Edebali Üniv. Fen Edebiyat Fak. 2013- Bölüm Başkanı Moleküler Biyoloji ve Genetik Böl. Moleküler Biyoloji ve Genetik 2013- VERMİŞ OLDUĞU DERSLER Akademik Dönem Dersin Adı Bakterilerde Dormansi Haftalık Saati Teorik Uygulama 3 0 Öğrenci Sayısı Doktora Yüksek Lisans Lisans İki Bileşikli Fosforlama Sistemleri Bakteri Fizyolojisi Mikrobiyal Ekoloji Gen Regülasyonu Mikrobiyoloji Mikrobiyoloji Lab. Mikoloji Tıbbi Mikrobiyoloji Viroloji Biyoteknoloji Mesleki İngilizce Bitirme Tezi 1 ve 2 TEZ YÖNETİMİ Yüksek Lisans Konu 3 3 3 3 3 0 2 3 3 4 3 4 0 0 0 0 0 3 0 0 0 0 0 0 Tez Sahibi Yıl Zengin besiyerinde bazı dezenfektan özellikli kimyasal maddelerin Hülya Yılmaz Escherichia coli’nin OmpC ve OmpF porin protein sentez düzeyine etkisi. Dumlupınar Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Kütahya 2008 Fotooksidatif stress altında Escherichia coli’nin yaşamına FUR Ebru Aydın regulator proteininin etkisi. Dumlupınar Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Kütahya 2010 Fotooksidatif stresin Escherichia coli’de porin protein sentez Öznur Aktop düzeyine etkisinin araştırılması. Dumlupınar Üniversitesi, Fen 2011 Bilimleri Enstitüsü, Kütahya Doktora Konu Tez Sahibi Yıl AKADEMİK ÇALIŞMALAR Tezler Konu Derecesi Yıl Yüksek Deniz suyunda dezenfektan kimyasal maddelerin Escherichia coli 1999 Lisans ML30 ve Salmonella typhimurium LT2 bakterilerinin protein sentezine Doktora olan etkileri. Danışman; Doç. Dr. reşit ÖZKANCA Karadeniz suyunda pH, osmolarite ve açlık stresinin Escherichia 2005 coli’nin dış membran porin protein sentez düzeyine etkisinin araştırılması. Danışman; Prof. Dr. Reşit ÖZKANCA Projeler Projenin Adı Projedeki Görevi 1. TÜBİTAK 113T003 nolu ‘’CusSCusR, BasS- Yürütücü BasR, ve YfhK-YfhA Iki Bilesikli Fosforlama Sistemlerinin Farklı Stres Sartlarında (pH, Osmolarite, Bazı Antibiyotikler ve Metallere) Görev Süresi 1 yıl Yıl 2013-devam ediyor Escherichia Coli W3110'nun Yasamındaki Rollerinin Arastırılması" 2. Bilecik ŞEÜ. BAP Escherichia coli’de EnvZ- Yürütücü 1,5 yıl OmpR, CpxA-CpxR ve ArcA-ArcB iki bileşikli 2013-Devam ediyor fosforlama sistemlerinin sensör ve regülatör proteinlerinin farklı stres şartlarında bakteri yaşamındaki rollerinin araştırılması 3. Amasya Üniv. BAP E. coli Isı Şok Proteinleri Yardımcı 1 yıl IbpA Ve IbpB nin Farklı Stres Şartları Altındaki Araştırmacı, 2013-devam ediyor Rollerinin Belirlenmesi 4. Amasya Üniv. BAP Fotooksidatif stres altında Yardımcı oksidatif stres 1 yıl rollerinin Araştırmacı enzimlerinin araştırılması 5. Amasya Üniv. BAP, E. coli cya (adenilat Yardımcı 2013-devam ediyor 1 yıl siklaz) ve crp (CRP proteini) genlerinin Farklı Araştırmacı 2014-devam ediyor Stres Şartları Altındaki Rollerinin Belirlenmesi 6. Bilecik ŞEÜ. BAP Şerbetçi Otu (Humulus Yardımcı lupulus) Rizosfer Toprağında 1 yıl Aktinomiset Araştırmacı 2013-devam ediyor Biyoçeşitliliğinin Belirlenmesi 7. DPU-BAP 2007-4 ’Farklı Kimyasal Maddelerin Yürütücü Escherichia coli’nin Dış 2 yıl 2007-2009 2,5 yıl 2010-2012 2 yıl 2003-2005 3 yıl 2001-2004 Membran Proteinlerinden OmpC ve OmpF porin protein sentezine etkisi ve mekanizmanın ortaya konulması’’ 8. TÜBİTAK TBAG 109T201. Gözenekli koordinasyon polimerlerinin sentezi, karakterizasyonu, antimikrobiyal özelliklerinin Yardımcı araştırmacı ve kuantum mekaniksel yöntemlerle konformasyonu araştırılması’’ TBAG-2084 9. TÜBİTAK Membran porin 101T123 proteinleri ve ‘’Dış Yardımcı çevresel Araştırmacı sensörler bakımından (OmpC, OmpF, EnvZ, OmpR vb.) mutant olan Escherichia coli bakterisinin osmotik stres ve diğer çevresel parametreler altındaki yaşamı ve geliştirdiği stratejilerin belirlenmesi’’ OMU BAP F-271 numara’lı ‘’Farklı Yardımcı 10. çevresel parametrelerin türlerinin yaşamına ve enterik dış bakteri Araştırmacı membran proteinlerine etkisi‘’ ESOGU BAP 11. 200819042- Dikarboksilik Asitler Polimerlerinin Sentezi, Kuantum İle Mekaniksel Halkalı Yardımcı 2 yıl 2008-2010 3 yıl 2009-2011 Koordinasyon Araştırmacı, Karakterizasyonu, Yöntemlerle Konformasyonu, Antimikrobiyal Özelliklerinin Araştırılması 12. Bor Enstitüsü 2009-Ç-0214 ‘’Ticari Olarak Üretilen Bazı Bor Ürünlerinin Anti- Yardımcı Araştırmacı mikrobiyal, Antikanserojenik ve Göl Suyunda Bakteri Yaşamı Üzerine Etkilerinin Araştırılması’’ Kitapları Kitabın Adı Yayınevi ISBN Yıl Uluslararası Dergilerde Yayınlanan Makaleler 1. Darcan C., Özkanca R. and Flint K.P. 2003. Survival of nonspecific porin-deficient mutants of Escherichia coli in black sea water. Letters in Applied Microbiology 37, 380-385. 2. Yeşilel O.Z., Dege N., Darcan C. and Büyükgüngör O. 2007. Synthesis, crystal structure, spectral, thermal characterization and antimicrobial activity of [Cu(HOr)(aepy)(H 2O)]∙H2O (aepy = 2-aminoethylpyridine). Z. Naturforsch. 62b, 1590 – 1594 3. Yeşilel O.Z., Darcan C. and Şahin E. 2008. The First Hydroxo-Bridged Saccharinate complex: Synthesis, IR spectroscopy, thermal analysis, X-ray structure and antimicrobial activities of di-μ-hydroxo-bis[aqua(2,2-diethylethylendiamine) (saccharinato)copper(II)] dihydrate. Polyhedron 27, 905-913. 4. Darcan C., Özkanca R and İdil Ö. 2009. The role of EnvZ, RpoS, H-NS and AcP on the expression of OmpF and OmpC porins of Escherichia coli at different pH. African Journal of Biotechnology, 8 (9), 1845-1854. 5. Erer H., Yesilel OZ., Darcan C. and Büyükgüngör O. 2009. Synthesis, spectroscopic, thermal Studies, antimicrobial activities and crystal structures of Co(II), Ni(II), Cu(II) and Zn(II)-orotate complexes with 2-methylimidazole. Polyhedron, 28, 3087–3093 6. Darcan C., Özkanca R., İdil Ö and Flint K.P. 2009. The relation between VBNC with porin proteins of Escherichia coli under pH, osmolarity, starvation stress in sea water. Polish Journal of Microbiology 54, 4, 307-319. 7. İdil Ö., Özkanca R., Darcan C. and Flint K.P. 2010. Escherichia coli: Dominance of red light over other visible light sources in establishing viable but nonculturable state. Photochemistry and Photobiology, 86, 104-109. 8. Yeşilel O.Z., Mutlu A., Darcan C. and Büyükgüngör O. 2010. Synthesis, spectral, thermal, structural characterization and antimicrobial activities of novel cobalt-pyrazine2,3-dicarboxylic acid complexes with N-donor ligands. Journal of Molecular Structure 964, 39-46. 9. Yesilel O.Z., Kastas G., Darcan C., Ilker I., Pasaoğlu H. and Buyukgungor O. 2010. Syntheses, thermal analyses, crystal structures and antimicrobial properties of silver(I)saccharinate complexes with diverse diamine ligands. Inorganica Chimica Acta 363, 1849–1858. 10. Ozen T., Darcan C., Aktop O. and Turkekul I. 2011, Screening of antioxidant, antimicrobial activities and chemical contents of edible mushrooms wildly grown in the Black Sea region of Turkey. Combinatorial Chemistry & High Throughput Screening, 14, 72-84. 11. Erer H., Yesilel O.Z., Darcan C. and Büyükgüngör O. 2011, Co(II), Ni(II) and Zn(II)orotate complexes with N-methylimidazole: Synthesis, crystal structures and antimicrobial activities. Polyhedron 30, 2406–2413. 12. Idil Ö., Darcan C. and Ozkanca R. 2011, The Effect of UV-A and different wavelengths of visible lights on survival of Salmonella typhimurium in sea water microcosms. Journal of Pure and Applied Microbiology, 5(2), p. 581-592. 13. Yesilel O.Z., Gunay G., Darcan C., Soylu M.S., Keskin S. and Weng Ng S. 2012, An unusual 3D metal–organic framework, {[Ag4 (m 4-pzdc)2 (m -en)2 ].H2O} n: C–H/Ag, N– H/Ag and (O–H)/Ag interactions and an unprecedented coordination mode for pyrazine2,3-dicarboxylate, CrystEngComm, 14, 2817-2824. 14. Yesilel O.Z., Ilker I., Soylu M.S, Darcan C. and Süzen Y. 2012, Synthesis, crystal structures and antimicrobial properties of copper (II)-thiophene-2,5-dicarboxylate complexes with N-donor ligands, Polyhedron 39, 14–24. 15. Darcan C. and Kahyaoğlu M. 2012, The effect of some Boron derivatives on Kanamycin resistance and survival of Escherichia coli and Pseudomonas aeruginosa in lake water. Biomed Environ Sci, 25(4):373-380. 16. Darcan C. and Aydın E. 2012, fur- mutation increases the survival time of Escherichia coli under photooxidative stres in aquatic environments. Acta Biologica Hungarica 63(3), 412–422. 17. Darcan C. 2012 Expression of OmpC-OmpF porin proteins and survival of Escherichia coli under photooxidative stress in Blacksea water: insights from microcosm studies. Aquatic Biology 17: 97–105. 18. İdil Ö., Darcan C., Özen T. and Özkanca R. 2013. The Effect of UV-A and various visible light wavelenghts radiation on expression level of Escherichia coli oxidative enzymes in seawater. Jundishapur Journal of Microbiology, 6 (3) 226-232. 19. Büyükkıdan N., Yenikaya C., İlkimen H., Karahan C., Darcan C. and Şahin E. 2013, Synthesis, characterization and antimicrobial activity of a novel proton salt and its Cu(II) complex. Russian Journal of Chemistry 39 (1), 96–103. 20. Günay G., Yesilel O.Z., Darcan C., Keskin S. and Büyükgüngör O. 2013. Synthesis, crystal structures, molecular simulations for hydrogen gas adsorption, fluorescent and antimicrobial properties of pyrazine-2,3-dicarboxylate complexes. Inorganica Chimica Acta 399, 19–35. 21. Semerci F., Yesilel O.Z., Keskin S., Darcan C., Tas M. and Dal H. 2013. Construction of homo- and heterometallic-pyridine-2,3-dicarboxylate metallosupramolecular networks with structural diversity: 1D T5(2) water tape and unexpected coordination mode of pyridine-2,3dicarboxylate. CrystEngComm, 2013, 15, 1244–1256. 22. Gupta V.K., Atar N., Yola M.L., Darcan C., İdil Ö., Üstündağ Z. and Suhas. 2013. Biosynthesis of silver nanoparticles using chitosan immobilized Bacillus cereus: Nanocatalytic studies. Journal of Molecular Liquids 188; 81–88. 23. Darcan C., Kaygusuz Ö. and Korkmaz T. 2013. Antimicrobial effectiveness of [Cu(pzdc) (phen)2]·5.5H2O complex on some microorganisms. Journal of Pure and Applied Microbiology, Vol 7, No: 4 baskıda Ulusal Dergilerde Yayınlanan Makaleler 1. Darcan C., Özkanca R., Şahin N., Işık K., Kariptaş E. 2001 Dezenfektan özellikteki bazı kimyasal maddelerin deniz suyundaki E. coli ML30 ve S. typhimurium LT2 nin dış membran protein sentezine etkisi. Biyoteknoloji Dergisi, 25 (2), 57-66. 2. Darcan, C. ve Özkanca, R. 2007 Nutrient brot besiyerinde Escherichia coli’nin OmpF ve OmpC porin protein sentezi ve EnvZ, OmpR, H_NS, Acp ve RpoS’nin rolü. Dumlupınar Üniversitesi Fen Bilimleri Dergisi, Dumlupınar Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü Dergisi 14, 1-10. Uluslararası Sempozyum / Konferans / Kongre Bildirileri 1. Bekdemir Y., Kutuk H., Ozkanca R., Maras FZ., Darcan C., Çelik S., Isik K.. 2004. Substituent Effects on Antimicrobial Activities of Some Sulfonamides The 15th European Symposium on Quantitative Structure-Activity Relationships & Molecular Modelling, 0510 September 2004. İstanbul, B-118. 2. Kahyaoğlu M., Darcan C., Ergene E. 2009. Bor Bileşiklerinin Mikrobiyal Etkileri ve Kullanım Alanları. Proceedings of the 4th International Boron Symposium, 15-17 Ekim 2009 Eskişehir, sayfa 209. 3. Büyükgüngör O., Yeşilel OZ., Mutlu A. and Darcan C. 2010. Characterization and Antimicrobial Activities of Cobalt-Pyrazine-2,3-dicarboxylate Complexes. FA4-MS34-P10, 26th European Crystallographic Meeting, ECM 26, Darmstadt, 2010 Page s262 Ulusal Sempozyum / Konferans / Kongre Bildirileri 1. Özkanca R., Darcan C., Aydın A. 2001. Fotosensitizer olan metilen mavisinin deniz suyunda yaşayan E. coli, S. typhimurium, K. pneumoniae, P. aeurginosa’nın yaşamına yaşamına etkisi. XII. Biyoteknoloji Kongresi, Ayvalık/Balıkesir, 17-21 Eylül 2001. Bildiriler Kitabı s. 285-288. (Sözlü Sunum) 2. C. Darcan, Ö. İdil ve R. Özkanca. 2005. Farklı pH’larda RpoS, HNS ve AcP’nin Escherichia coli’ nin OmpF ve OmpC porin protein sentezindeki rolü. XIV. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi, 31 Ağustos-2 Eylül 2005, ESOGU,Eskişehir (Sözlü Sunum) 3. R. Özkanca, Ö. İdil, C. Darcan, 2008. Deniz suyunda farklı dalga boylu ışınların E. coli ve S. typhimurium’un lipit peroksidasyonuna etkisi. 19. Biyoloji Kongresi, SM066 22-27 Haziran 2008, KTÜ, Trabzon-Türkiye. (Sözlü Sunum) 4. C. Darcan, R. Özkanca, Ö. İdil. 2008. Deniz suyunda açlık stresi ve besin ilavesinin E. coli’nin OmpC ve OmpF sentezine etkisi ve RpoS, H-NS, AcP’ın rolü. 19. Biyoloji Kongresi 22-27 Haziran 2008, SM052, KTÜ, Trabzon-Türkiye. (Sözlü Sunum) 5. S. ERGİN ve C. DARCAN, 2008. Farklı Su Kaynaklarında Fotooksidatif Stresin Enterobacter aerogenes’in Yaşamına Etkisinin Araştırılması 15. Ulusal Biyoloji Öğrenci Kongresi, 27-30 Ağustos 2008, Gaziantep Üniversitesi, Özet Kitabı s. 43 (Sözlü Sunum) 6. C. Darcan, Ö. İdil. 2010 E. coli’nin deniz suyundaki fotooksidatif stres altındaki yaşamında OmpR regülatör proteininin rolü. 20. Ulusal Biyoloji Kongresi, 21-25 Haziran, S090, Bildiri özetleri kitabı sayfa 106-107, Pamukkale Üniversitesi, Denizli- (Sözlü Sunum) 7. C. Darcan, 2010. Fotooksidatif Stres Altında Yaşam için E. coli’de OmpR nin Rolü. ESİNKAP 2. ‘Ar-Ge Proje Pazarı’ için Proje Özeti, 29-30 Nisan 2010 Eskişehir Sanayi Odası-Eskişehir. (Sözlü Sunum) 8. O. Arslan, A. Özgür, C. Darcan, 2010. Jeotermal Destekli Gıda Soğutma ve Kurutması. ESİNKAP 2. ‘Ar-Ge Proje Pazarı’ için Proje Özeti, 29-30 Nisan 2010, Eskişehir Sanayi Odası-Eskişehir. (Sözlü Sunum) 9. C. Darcan ve M. Kahyaoğlu 2011. Göl suyunda ticari olarak üretilen bazı bor ürünlerinin E. coli ve P. aeruginosa’nın yaşamına ve kanamisin antibiyotiğine dirençleri üzerine etkisi. FABA Sempozyumu, PSST-91, 7-9 Eylül 2011, sayfa:96, Ondokuz Mayıs Üniversitesi, Samsun. (Sözlü Sunum) 10. C. Darcan, R. Özkanca 2000. Deniz suyunda bazı dezenfektan maddelerin E. coli ML30 ve S. typhimurium LT2 nin protein sentezine etkisi. XV. Ulusal (Uluslararası Katılımlı) Biyoloji Kongresi, 5-9 Eylül 2000, Ankara, Özetler Kitabı, MBP16 (Poster Sunum) 11. Ö. İdil, C. Darcan, R. Özkanca 2001 Bazı dezenfektan özellikteki kimyasal maddelerin Karadeniz suyunda yaşayan E. coli ve S. enteritidis’in yaşamına etkisi. XII. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi, 17-21 Eylül 2001 Ayvalık/Balıkesir, Bildiri Kitabı s. 117. (Poster Sunum) 12. Ö. İdil, C. Darcan, H. Karakaya, R. Özkanca 2005. Deniz suyunda, E. coli ve S. typhimurium’un uyku durumuna (dormant) girmesinde oksidatif stres ve değişik dalga boyundaki ışınların etkisi. XIV. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi, 31 Ağustos-2 Eylül 2005, Bildiri ve Poster Kitabı s. 509. (Poster Sunum) 13. C. Darcan, Ö. İdil, R. Özkanca, 2005. Deniz suyunda, E. coli’nin yaşamının pH, açlık ve osmotik stresin etkisi altında dormansi ve porin proteinleri ile ilişkisi. XIV. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi, 31 Ağustos-2 Eylül 2005, Bildiri ve Poster Kitabı s. 510. (Poster Sunum) 14. Ö. İdil, C. Darcan, H. Karakaya ve R. Özkanca 2005. Deniz suyunda, fotosensitizer olan metilen mavisi ve değişik dalga boyundaki ışınların E. coli ve S. typhimurium’un oksidatif stres enzim aktivitesi ile ilişkisi. XIV. Ulusal Biyoteknoloji Kongresi, 31 Ağustos-2 Eylül 2005, Bildiri ve Poster Kitabı. s. 511. (Poster Sunum) 15. S. Ergin ve C. Darcan. 2007. Büyük Tehlike; Bakterilerdeki Dormansi. XIV. Ulusal Biyoloji Öğrenci Kongresi, 3-6 Eylül, Selçuk Üniversitesi, Konya Bildiri ve Poster Kitabı s:109. (Poster Sunum) 16. C. Darcan, Ö. Aktop ve S. Çalışkan 2010. Bazı pirazin dikarboksilik asit metal komplekslerinin antimikrobiyal aktivitesinin araştırılması ve CuPzDKAphen’nin etkinliğinin ortaya konulması, 20. Ulusal Biyoloji Kongresi, 21-25 Haziran PG050, sayfa 941, Pamukkale Üniversitesi, Denizli. (Poster Sunum) 17. C Darcan, N Atar, Ö İdil, B.N. Yener, B.O. Atalar, Z Üstündağ 2012 Bacillus cereus hücresiz ekstraktı kullanılarak gümüş nano parçacıklarının elde edilmesi ve katalizör olarak kullanılması. 21. Ulusal Biyoloji Kongresi, 3-7 Eylül 2012, Ege üniversitesi, İzmir. (Poster Sunum) Ulusal ve Uluslararası Yayınlarına Yapılan Atıflar 09.12.2013 tarihi itibari ile web of Science Atıf indeksi; Results found: 21 Sum of the Times Cited : 88 Sum of Times Cited without self-citations : 56 Citing Articles : 70 Citing Articles without self-citations : 54 Average Citations per Item : 4.19 h-index : 6 Hakemlik ve Yayın Kurulu Deneyimi World Journal of Microbiology and Biotechnology African journal of Biotechnology BİLİMSEL KURULUŞLARA ÜYELİKLER KATILDIĞI SEMİNERLER / TARTIŞMALAR / BİLGİ ŞÖLENLERİ KATILDIĞI BİLİMSEL VE TEKNİK GEZİLER ALMIŞ OLDUĞU HİZMETİÇİ EĞİTİM VEYA KURSLAR ÖDÜLLER Aldığı Ödül Yıl